RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 JKAMPQ9P055 326 aa18.25■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 LY96Q9Y6Y9 160 aa18.25■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 E9PLN8 166 aa18.24■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 H3BRM9 83 aa18.24■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 M0R2Z0 102 aa18.24■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 CXCL13O43927 109 aa18.24■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 DHRS3O75911 302 aa18.24■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 GPM6AP51674 278 aa18.24■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 OR4A5Q8NH83 315 aa18.24■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 C18orf32Q8TCD1 76 aa18.24■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 SCRT2Q9NQ03 307 aa18.24■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 V9GYV3 84 aa18.24■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 K7EN84 100 aa18.24■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 PLCXD3Q63HM9 321 aa18.24■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 Q6ZRM9 215 aa18.24■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 SPATA12Q7Z6I5 190 aa18.24■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 OR2Z1Q8NG97 314 aa18.24■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 OR2K2Q8NGT1 345 aa18.24■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 JMJD8Q96S16 334 aa18.24■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 TMEM70Q9BUB7 260 aa18.24■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 PSMB11A5LHX3 300 aa18.23■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 TMEM189A5PLL7 270 aa18.23■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 CRXO43186 299 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 TNXAQ16473 311 aa18.23■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 SPANXN5Q5MJ07 72 aa18.23■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 BRICD5Q6PL45 260 aa18.23■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 COLCA1Q6ZS62 124 aa18.23■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa18.23■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 APC2O95996 2303 aa18.23■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 DHHO43323 396 aa18.23■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 AMY1AP04745 511 aa18.23■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 CELA3AP09093 270 aa18.23■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa18.23■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 LINC00696Q6ZRV3 163 aa18.23■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 OR10D3Q8NH80 312 aa18.23■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 MRAP2Q96G30 205 aa18.23■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 PLEK2Q9NYT0 353 aa18.23■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 CACNG5Q9UF02 275 aa18.23■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa18.22■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 ZNF716A6NP11 495 aa18.22■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 CD300LBA8K4G0 201 aa18.22■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 GPR183P32249 361 aa18.22■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 ABHD17BQ5VST6 288 aa18.22■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 TMEM147Q9BVK8 224 aa18.22■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa18.22■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 GAGE12HA6NDE8 117 aa18.22■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 ANGPTL7O43827 346 aa18.22■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 F2RP25116 425 aa18.22■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 GRB2P62993 217 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 GABRA6Q16445 453 aa18.22■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa18.22■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa18.22■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 F2RL2O00254 374 aa18.21■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa18.21■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 IGF2-ASQ6U949 168 aa18.21■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 Q6ZS49 121 aa18.21■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 Q6ZSR3 168 aa18.21■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 RAB1CQ92928 201 aa18.21■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 CCL28Q9NRJ3 127 aa18.21■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 ACACAQ13085 2346 aa18.21■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 A0A087X0K7 114 aa18.21■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa18.21■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 IGKV1-13P0DP09 117 aa18.21■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 ZNF835Q9Y2P0 537 aa18.21■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 C9JCJ5 164 aa18.2■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 DNPH1O43598 174 aa18.2■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 PDCD6O75340 191 aa18.2■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 WT1P19544 449 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 CRIM1Q9NZV1 1036 aa18.2■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 PIGLQ9Y2B2 252 aa18.2■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa18.2■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 TUSC2O75896 110 aa18.2■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 APCSP02743 223 aa18.2■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 OR1C1Q15619 314 aa18.2■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa18.2■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 OR1F12Q8NHA8 337 aa18.2■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 SPATA25Q9BR10 227 aa18.2■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 ZNF407Q9C0G0 2248 aa18.19■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 MGAQ8IWI9 3026 aa18.19■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 SCO2A0A1W2PP80 73 aa18.19■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 K7EQM0 130 aa18.19■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 TSPAN13O95857 204 aa18.19■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 MALLQ13021 153 aa18.19■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 ZNF841Q6ZN19 808 aa18.19■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa18.19■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 MS4A6AQ9H2W1 248 aa18.19■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 NCOR2Q9Y618 2525 aa18.19■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 hDV102S1A0JD36 115 aa18.19■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 CD1BP29016 333 aa18.19■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 FAM173AQ9BQD7 235 aa18.19■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa18.19■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms