RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249700.8

TMOD2-201, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD2, Length 9,191 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-201ENST00000249700 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 FREM1Q5H8C1 2179 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 AHRRA9YTQ3 701 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 CDK2AP2O75956 126 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 SYT8Q8NBV8 401 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 SFXN3Q9BWM7 321 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 TNFSF13O75888 250 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 ATP6V0CP27449 155 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 PRDX2P32119 198 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 KIR2DS2P43631 304 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 GLRX5Q86SX6 157 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 SAXO1Q8IYX7 474 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 PEMTQ9UBM1 199 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 RNF114Q9Y508 228 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 FRYLO94915 3013 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 A0A0G2JRQ6 117 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 PPP5D1E7EU14 171 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 PHOX2AO14813 284 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 BSPH1Q075Z2 132 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 WDR82Q6UXN9 313 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF714Q96N38 554 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 PCNX3Q9H6A9 2034 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 WDFY4Q6ZS81 3184 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF727A8MUV8 499 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 A8MXK9 166 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 TMEM50AO95807 157 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 PGA5P0DJD9 388 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 PPIAL4GP0DN37 164 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 FFAR4Q5NUL3 377 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 OR4C5Q8NGB2 326 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 Q8WTZ3 238 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 BET1LQ9NYM9 111 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 KCNJ3P48549 501 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 SLC35E4Q6ICL7 350 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 CD99P14209 185 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 TCF21O43680 179 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 P2RY1P47900 373 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 DYNLT3P51808 116 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 FABP9Q0Z7S8 132 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 RPL39P5Q59GN2 51 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 C17orf98A8MV24 154 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 RNF223E7ERA6 249 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 PCSK4Q6UW60 755 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 ETV3LQ6ZN32 361 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 Q6ZN92 141 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 ACP7Q6ZNF0 438 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 LAMA1P25391 3075 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 TMEM131Q92545 1883 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 S1PR2O95136 353 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 PMCHP20382 165 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 CCKARP32238 428 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 MDH2P40926 338 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 DKK4Q9UBT3 224 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 HERVK_113P61574 105 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 Q6ZRM9 215 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 FAM222BQ8WU58 562 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 RNF2Q99496 336 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 RSG1Q9BU20 258 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 A6NDN8 102 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 H3BVH4 76 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 MT-ND4LP03901 98 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 OR5AL1P0C617 328 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 UCP1P25874 307 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 DUX3Q96PT4 197 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 CABLES2Q9BTV7 478 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 USF1P22415 310 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 GALR1P47211 349 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 MSMPQ1L6U9 139 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 COQ2Q96H96 371 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 VPS13AQ96RL7 3174 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 NOTCH3Q9UM47 2321 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 PSMB11A5LHX3 300 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 IQCF6A8MYZ5 107 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 PPP1R17O96001 155 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 TRGV3P03979 118 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 LIPFP07098 398 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 RNF212Q495C1 297 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 ELOVL5Q9NYP7 299 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-201ENST00000249700 H0Y980 276 aa5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.4 ms