RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 H3BQ15 152 aa18.57■□□□□ 0.56
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HOXD9-201ENST00000249499 OPN1MW2P0DN77 364 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD9-201ENST00000249499 OPN1MW3P0DN78 364 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD9-201ENST00000249499 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
HOXD9-201ENST00000249499 PRR20EP86478 221 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD9-201ENST00000249499 PRR20CP86479 221 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD9-201ENST00000249499 PRR20DP86480 221 aa18.48■□□□□ 0.55
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HOXD9-201ENST00000249499 PRR20AP86496 221 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD9-201ENST00000249499 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HOXD9-201ENST00000249499 RNF5Q99942 180 aa18.48■□□□□ 0.55
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