RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rab9aQ9R0M6 201 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CnmdQ9Z1F6 334 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm42517A0A1Y7VLQ2 374 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wfdc11A2A5H7 82 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr906K7N5P3 311 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ifna6P07350 189 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clec4a1Q80UI7 245 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ifna16Q810G1 189 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PaplnQ9EPX2 1280 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Angptl4Q9Z1P8 410 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trbv23A0A0A6YWQ1 115 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stfa1P35175 97 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fabp7P51880 132 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd96Q3U0X8 602 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc7a15Q50E62 488 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr153Q7TR48 307 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr924Q7TRB8 308 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem106cQ80VP8 260 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BivmQ8CBX9 502 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dmrta1Q8CFG4 490 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc6a8Q8VBW1 640 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nit1Q8VDK1 323 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1368Q8VFG3 314 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cxcr6Q9EQ16 351 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr926Q9EQ98 308 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Insl6Q9QY05 191 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igkv6-14A0A140T8P1 115 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pusl1A2ADA5 291 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1158A2BHP7 313 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm15056F6ZR08 88 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PspnO70300 156 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdkn1bP46414 197 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 EcscrQ3TZW0 214 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Defa-rs10Q64263 91 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1357Q7TQU7 313 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psg16Q8K0U8 395 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr507Q8VG13 316 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scgb3a2Q920H1 91 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ociad1Q9CRD0 247 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nup210lQ9D2F7 1881 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm45861A0A1B0GRY3 1923 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mmp27D3YV89 551 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lgals9O08573 353 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tcstv1O70619 171 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hnf1aP22361 628 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lhfpl5Q4KL25 219 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r195Q5SVD6 316 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r50Q9EP51 310 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ammecr1Q9JHT5 344 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cited4Q9WUL8 182 aa11.07□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Birc7A2AWP0 285 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1ccP63087 323 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hist1h2baP70696 127 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SelenohQ3UQA7 116 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spem1Q5F289 310 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccsmst1Q6RUT7 136 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sys1Q78S06 156 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr91Q7TRL3 312 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cela3bQ9CQ52 269 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem116A0A0G2JGD3 401 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igk-V19-17P01633 149 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ifna5P07349 189 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rab5cP35278 216 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ca10P61215 328 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ube2g1P62254 170 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Isoc2aP85094 206 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lhfpl4Q5U4E0 247 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smug1Q6P5C5 279 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fblim1Q71FD7 375 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ankrd34cQ8BLB8 534 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hspb9Q9DAM3 168 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 A0A286YDM5 308 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp229E9PWT2 705 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Defa-rs12P50716 91 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spata22Q5SV06 358 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tex261Q62302 196 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GfralQ6SJE0 393 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 9030612E09RikQ8CE20 140 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dll4Q9JI71 686 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd8bP10300 213 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd5P13379 494 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GastP48757 101 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc25a4P48962 298 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DbpQ60925 325 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp874aQ8BX23 447 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r73Q8R293 303 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znhit1Q8R331 154 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr129Q8VEY1 330 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1086Q8VFL9 310 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gtf3aQ8VHT7 364 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrps16Q9CPX7 135 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem42Q9CR22 157 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scp2d1Q9DAH1 156 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmprss2Q9JIQ8 490 aa11.06□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv5-2A0A0A6YVX8 117 aa11.05□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cldn20G5E8X0 219 aa11.05□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ankrd33bQ3U0L2 486 aa11.05□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp941Q3URY5 674 aa11.05□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r211Q8R266 298 aa11.05□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mus81Q91ZJ0 551 aa11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.1 ms