RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630224.2

TCF4-269, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 501 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-269	ENST00000630224	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	C2orf50	Q96LR7	162 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	NABP2	Q9BQ15	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224		A0A1B0GU03	582 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224		H0YJW9	148 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	CCS	O14618	274 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	RAMP3	O60896	148 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	ADAP1	O75689	374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	SNAPC5	O75971	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	OR2A4	O95047	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	SIX6	O95475	246 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	KRAS	P01116	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	PET100	P0DJ07	73 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	SLC25A6	P12236	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	BRS3	P32247	399 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	SAA4	P35542	130 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	LGALS7	P47929	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	FGL1	Q08830	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	SSX2	Q16385	188 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	OR1S1	Q8NH92	325 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	DDB2	Q92466	427 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	OR2A7	Q96R45	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	NMES1	Q9C002	83 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	WRB	O00258	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	TIMM23	O14925	209 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	IGKV1-5	P01602	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	RLN2	P04090	185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	FAM106CP	P0CH98	169 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	PSMB6	P28072	239 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	CD1B	P29016	333 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	G6PC	P35575	357 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	H2BFS	P57053	126 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	LINC00205	P59089	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	OR10C1	Q96KK4	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	RNF5	Q99942	180 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	COA4	Q9NYJ1	87 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	CACNG5	Q9UF02	275 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224		A0A1W2PPI3	338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	MED6	O75586	246 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	SPDEF	O95238	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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