RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 HRASLSQ9HDD0 168 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 TAS2R8Q9NYW2 309 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 METTL21EPA6NDL7 271 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4C46A6NHA9 309 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 S1PR2O95136 353 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV1-13P0DP09 117 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM190Q8WZ59 177 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP6D1Q9H9H5 199 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 CTXN2P0C2S0 81 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 DTYMKP23919 212 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 FABP5Q01469 135 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 KLK9Q2XQG4 91 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 MFSD4AQ8N468 514 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 MFFQ9GZY8 342 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 THYN1Q9P016 225 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 KLK9Q9UKQ9 250 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 PDCD5O14737 125 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 TGOLN2O43493 480 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV2-14P01704 120 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB6AP20340 208 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR20EP86478 221 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR20CP86479 221 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR20DP86480 221 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR20BP86481 221 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR20AP86496 221 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 SSX1Q16384 188 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf45Q8TAV5 145 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 C20orf24Q9BUV8 137 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ATG5Q9H1Y0 275 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10A3P58181 314 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 IRF3Q14653 427 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CD300LFQ8TDQ1 290 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 GPHA2Q96T91 129 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 RARRES2Q99969 163 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2T8A6NH00 312 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CGB1A6NKQ9 187 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ARL6IP1Q15041 203 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 RCN1Q15293 331 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 APRG1Q8IVJ8 170 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4A5Q8NH83 315 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2B8PP59922 312 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CDNFQ49AH0 187 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF66Q6ZN08 573 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ACOT13Q9NPJ3 140 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 BET1LQ9NYM9 111 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 RYR1P21817 5038 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 IFITM5A6NNB3 132 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 MPTX1A8MV57 137 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CYB5BO43169 146 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFSF12O43508 249 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 BRWD1-AS2P59051 145 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 C2CD4CQ8TF44 421 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 AIFM2Q9BRQ8 373 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 COMMD5Q9GZQ3 224 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC90BQ9GZT6 254 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CSTL1Q9H114 145 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLC7A0M8Q6 106 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 CNIH2Q6PI25 160 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 VCXQ9H320 206 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 MYL9P24844 172 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 SPAG16Q8N0X2 631 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 VN1R17PQ8TDU5 208 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 TPRKBQ9Y3C4 175 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 TFPI2P48307 235 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF124Q15973 351 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 HACD4Q5VWC8 232 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 OR11H2Q8NH07 326 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 SECTM1Q8WVN6 248 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 DCSTAMPQ9H295 470 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFA4O00483 81 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 RGS10O43665 173 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A24Q6NUK1 477 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 UBAC2Q8NBM4 344 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 MGLLQ99685 303 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV3A0A0B4J244 114 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB4AO15263 64 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB3BP20337 219 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 GNG2P59768 71 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10W1Q8NGF6 305 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
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