RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627212.2

RAPGEF6-215, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAPGEF6, Length 4,694 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR10S1Q8NGN2 331 aa8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 C18orf15Q96N68 181 aa8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 HERPUD1Q15011 391 aa8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 P2RY6Q15077 328 aa8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZNF441Q8N8Z8 693 aa8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR5P3Q8WZ94 311 aa8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 SYNGR3O43761 229 aa8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 IGHMP01871 453 aa8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.45□□□□□ -1.06
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RAPGEF6-215ENST00000627212 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.45□□□□□ -1.06
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RAPGEF6-215ENST00000627212 DLL1O00548 723 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 CELA3BP08861 270 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR5R1Q8NH85 324 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 DOCK4Q8N1I0 1966 aa8.44□□□□□ -1.06
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RAPGEF6-215ENST00000627212 DPRXA6NFQ7 191 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 J3QRE1 110 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 C1QTNF9P0C862 333 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 PLP1P60201 277 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 FAM117AQ9C073 453 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A0A6YYD4 124 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 PRSS2P07478 247 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 LOXL3P58215 753 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 DNASE2BQ8WZ79 361 aa8.44□□□□□ -1.06
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RAPGEF6-215ENST00000627212 TM2D1Q9BX74 207 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 PCNX2A6NKB5 2137 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 ATAD5Q96QE3 1844 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 NPIPB13A6NJU9 1138 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 NPIPB4C9JG80 1138 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 IFI6P09912 130 aa8.44□□□□□ -1.06
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RAPGEF6-215ENST00000627212 PMCHL1Q16048 86 aa8.44□□□□□ -1.06
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RAPGEF6-215ENST00000627212 CLDND2Q8NHS1 167 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 C7orf71A4D174 169 aa8.43□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 NAPSAO96009 420 aa8.43□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 HOXA5P20719 270 aa8.43□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 PTGDSP41222 190 aa8.43□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.43□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.43□□□□□ -1.06
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RAPGEF6-215ENST00000627212 IGHV3-23P01764 117 aa8.43□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 PSG7Q13046 419 aa8.43□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 LYZL4Q96KX0 146 aa8.43□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 WFDC1Q9HC57 220 aa8.43□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
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RAPGEF6-215ENST00000627212 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 MC5RP33032 325 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 C12orf54Q6X4T0 127 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZNF525Q8N782 197 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 FDCSPQ8NFU4 85 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 C16orf92Q96LL3 132 aa8.42□□□□□ -1.06
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RAPGEF6-215ENST00000627212 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.42□□□□□ -1.06
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RAPGEF6-215ENST00000627212 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 HIST1H2BKO60814 126 aa8.42□□□□□ -1.06
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RAPGEF6-215ENST00000627212 IL4P05112 153 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 HIST1H2BJP06899 126 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 HIST1H2BOP23527 126 aa8.42□□□□□ -1.06
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RAPGEF6-215ENST00000627212 HIST1H2BDP58876 126 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 HIST1H2BCP62807 126 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 FAM27E3Q08E93 113 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 ICAM4Q14773 271 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-215ENST00000627212 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.42□□□□□ -1.06
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