RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR5R1	Q8NH85	324 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR1S1	Q8NH92	325 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	COA4	Q9NYJ1	87 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	C1RL	Q9NZP8	487 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	BTBD17	A6NE02	478 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHST1	O43916	411 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	OPN1MW	P04001	364 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCGB2A2	Q13296	93 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRSS8	Q16651	343 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC51B	Q86UW2	128 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q8N9W7	124 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	C15orf61	A6NNL5	157 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL15RA	Q13261	267 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR4A5	Q8NH83	315 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	ST8SIA3	O43173	380 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCGB1D2	O95969	90 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	NMES1	Q9C002	83 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	AMY1A	P04745	511 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	M6PR	P20645	277 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	GNB1	P62873	340 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPINK9	Q5DT21	86 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF429	Q86V71	674 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	MMD2	Q8IY49	270 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRND	Q9UKY0	176 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576		E7EUB6	86 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMLR1	H3BR10	107 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACTL6B	O94805	426 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	CA2	P00918	260 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	CTRB1	P17538	263 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAP2B	P61225	183 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAB32	Q13637	225 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	AARD	Q4LEZ3	155 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q5BKY6	102 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	ESM1	Q9NQ30	184 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	FGF16	O43320	207 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFNA17	P01571	189 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	ID3	Q02535	119 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNFRSF9	Q07011	255 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNXA	Q16473	311 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	CRLF1	O75462	422 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	S100A10	P60903	97 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	HINT2	Q9BX68	163 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNIH1	O95406	144 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM157C	P0CG43	387 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	BLCAP	P62952	87 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	CX3CL1	P78423	397 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR5B3	Q8NH48	314 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	ASB13	Q8WXK3	278 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1B0GW64	132 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576		M0QZK8	103 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	MPC2	O95563	127 aa		7.26	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms