RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 TSC22D2O75157 780 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL12P30050 165 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 S100A11P31949 105 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 MMDQ15546 238 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 AANATQ16613 207 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 DTD1Q8TEA8 209 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CLCC1Q96S66 551 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 COMMD5Q9GZQ3 224 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A31Q9H0C2 315 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 TCF19Q9Y242 345 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0U1RQK1 487 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CEBPZOSA8MTT3 80 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 PAX6P26367 422 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R27Q86WC6 154 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 C1RLQ9NZP8 487 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 HKR1P10072 659 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM11P17152 192 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 PAX9P55771 341 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CNTFRP26992 372 aa24.83■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 C9orf139Q6ZV77 190 aa24.83■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 TMUB2Q71RG4 321 aa24.83■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 OR1L8Q8NGR8 309 aa24.83■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 ARL6Q9H0F7 186 aa24.83■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 PLXNB1O43157 2135 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM50AO95807 157 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 PRCDQ00LT1 54 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 PRSS8Q16651 343 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 HIPK2Q9H2X6 1198 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 PSENENQ9NZ42 101 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 CD5LO43866 347 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 CAV2P51636 162 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 MSGN1A6NI15 193 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 ACTL6BO94805 426 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 IAPPP10997 89 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 CD24P25063 80 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 F2RL1P55085 397 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 BAXQ07812 192 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 HNF4GQ14541 408 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 PLGLAQ15195 96 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXL15Q9H469 300 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 ENY2Q9NPA8 101 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 PLSCR3Q9NRY6 295 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 ZANQ9Y493 2812 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 RPP30P78346 268 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 OPCMLQ14982 345 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM252Q8N6L7 170 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 ZDHHC16Q969W1 377 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 BOLA1Q9Y3E2 137 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 CSMD1Q96PZ7 3565 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 INS-IGF2F8WCM5 200 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 C5orf64Q2M2E5 130 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEKHA3Q9HB20 300 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 TPSG1Q9NRR2 321 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 MYO9AB2RTY4 2548 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX15Q9BXT5 2789 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PN81 502 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM24AA6NFZ4 105 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 TAAR5O14804 337 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 CHRNA7P36544 502 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 SSX3Q99909 188 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNAB3O43448 404 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 BCL2L11O43521 198 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM120AOSQ5T036 256 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 STX12Q86Y82 276 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 GON7Q9BXV9 100 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 U3KQ87 197 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 ARPC5LQ9BPX5 153 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 COMPP49747 757 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 KRTAP1-1Q07627 177 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SPANXN5Q5MJ07 72 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 PITPNC1Q9UKF7 332 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 IGSF23A1L1A6 192 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SULT1A1P50225 295 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 PJVKQ0ZLH3 352 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 TNXAQ16473 311 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SPINK9Q5DT21 86 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 PIFOQ8TCI5 191 aa24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms