RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586027.5

GIPC1-205, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-205ENST00000586027 APELAP0DMC3 54 aa24.59■■□□□ 1.53
GIPC1-205ENST00000586027 VAMP1P23763 118 aa24.59■■□□□ 1.53
GIPC1-205ENST00000586027 MAS1LP35410 378 aa24.59■■□□□ 1.53
GIPC1-205ENST00000586027 TMEM268Q5VZI3 342 aa24.59■■□□□ 1.53
GIPC1-205ENST00000586027 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa24.59■■□□□ 1.53
GIPC1-205ENST00000586027 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa24.59■■□□□ 1.53
GIPC1-205ENST00000586027 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
GIPC1-205ENST00000586027 CGB1A6NKQ9 187 aa24.58■■□□□ 1.53
GIPC1-205ENST00000586027 DBX1A6NMT0 343 aa24.58■■□□□ 1.53
GIPC1-205ENST00000586027 SOX15O60248 233 aa24.58■■□□□ 1.53
GIPC1-205ENST00000586027 SFT2D2O95562 160 aa24.58■■□□□ 1.53
GIPC1-205ENST00000586027 OR2B8PP59922 312 aa24.58■■□□□ 1.53
GIPC1-205ENST00000586027 SLC35B1P78383 322 aa24.58■■□□□ 1.53
GIPC1-205ENST00000586027 GON7Q9BXV9 100 aa24.58■■□□□ 1.53
GIPC1-205ENST00000586027 NUDT15Q9NV35 164 aa24.58■■□□□ 1.53
GIPC1-205ENST00000586027 TRAV6A0A075B6T7 132 aa24.57■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 AKR1C2P52895 323 aa24.57■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 ANKRD55Q3KP44 614 aa24.57■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 AKIRIN2Q53H80 203 aa24.57■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 SHISA2Q6UWI4 295 aa24.57■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 LCNL1Q6ZST4 164 aa24.57■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 ZNF695Q8IW36 515 aa24.57■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 TEX22C9J3V5 150 aa24.56■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 IGHG4P01861 327 aa24.56■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 A0A1W2PN81 502 aa24.55■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 HMX3A6NHT5 357 aa24.55■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 FGF2P09038 288 aa24.55■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 ANXA3P12429 323 aa24.55■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 CHRNA7P36544 502 aa24.55■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 CD83Q01151 205 aa24.55■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 NRARPQ7Z6K4 114 aa24.55■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 SLC35G3Q8N808 338 aa24.55■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 OR4X2Q8NGF9 303 aa24.55■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 CASTOR1Q8WTX7 329 aa24.55■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 IL22RA2Q969J5 263 aa24.55■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 PHB2Q99623 299 aa24.55■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 C9orf170A2RU37 121 aa24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 SNAPC5O75971 98 aa24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 ATG12O94817 140 aa24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 IGLV1-40P01703 118 aa24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 OR4E1P0C645 316 aa24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 TEX38Q6PEX7 206 aa24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 TMEM14BQ9NUH8 114 aa24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 A0A0B4J293 547 aa24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 C15orf61A6NNL5 157 aa24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 Q6ZRM9 215 aa24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 OR5T1Q8NG75 326 aa24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 ENKURQ8TC29 256 aa24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 SPIN2AQ99865 258 aa24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 COMMD5Q9GZQ3 224 aa24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 PRNDQ9UKY0 176 aa24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 PSMB8P28062 276 aa24.53■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 DEFA1P59665 94 aa24.53■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 DEFA3P59666 94 aa24.53■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 DHRS2Q13268 280 aa24.53■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 FOXE3Q13461 319 aa24.53■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 LYZL2Q7Z4W2 148 aa24.53■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 LGI3Q8N145 548 aa24.53■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 GPR146Q96CH1 333 aa24.53■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 KLK15Q9H2R5 256 aa24.53■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 OR51B2Q9Y5P1 312 aa24.53■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 H2AFB2P0C5Z0 115 aa24.52■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 RAB25P57735 213 aa24.52■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 LYG2Q86SG7 212 aa24.52■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 COMMD1Q8N668 190 aa24.52■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 RNF152Q8N8N0 203 aa24.52■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 OR4A16Q8NH70 328 aa24.52■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
GIPC1-205ENST00000586027 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
GIPC1-205ENST00000586027 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa24.51■■□□□ 1.51
GIPC1-205ENST00000586027 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
GIPC1-205ENST00000586027 AREGP15514 252 aa24.51■■□□□ 1.51
GIPC1-205ENST00000586027 SRPXP78539 464 aa24.51■■□□□ 1.51
GIPC1-205ENST00000586027 C4orf46Q504U0 113 aa24.51■■□□□ 1.51
GIPC1-205ENST00000586027 DUSP18Q8NEJ0 188 aa24.51■■□□□ 1.51
GIPC1-205ENST00000586027 OR52B4Q8NGK2 314 aa24.51■■□□□ 1.51
GIPC1-205ENST00000586027 A0A0B4J2A0 478 aa24.5■■□□□ 1.51
GIPC1-205ENST00000586027 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa24.5■■□□□ 1.51
GIPC1-205ENST00000586027 ELANEP08246 267 aa24.5■■□□□ 1.51
GIPC1-205ENST00000586027 MECP2P51608 486 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
GIPC1-205ENST00000586027 C19orf35Q6ZS72 473 aa24.5■■□□□ 1.51
GIPC1-205ENST00000586027 FAM219AQ8IW50 185 aa24.5■■□□□ 1.51
GIPC1-205ENST00000586027 LRTM2Q8N967 370 aa24.5■■□□□ 1.51
GIPC1-205ENST00000586027 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
GIPC1-205ENST00000586027 TMEM68Q96MH6 324 aa24.5■■□□□ 1.51
GIPC1-205ENST00000586027 SHPKQ9UHJ6 478 aa24.5■■□□□ 1.51
GIPC1-205ENST00000586027 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa24.49■■□□□ 1.51
GIPC1-205ENST00000586027 NMSQ5H8A3 153 aa24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms