RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		19.53	■□□□□ 0.72
GPS1-223	ENST00000584229	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		19.53	■□□□□ 0.72
GPS1-223	ENST00000584229	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		19.53	■□□□□ 0.72
GPS1-223	ENST00000584229	OR5T1	Q8NG75	326 aa		19.53	■□□□□ 0.72
GPS1-223	ENST00000584229	SEC22A	Q96IW7	307 aa		19.53	■□□□□ 0.72
GPS1-223	ENST00000584229	SPIN2A	Q99865	258 aa		19.53	■□□□□ 0.72
GPS1-223	ENST00000584229	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		19.53	■□□□□ 0.72
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		19.53	■□□□□ 0.72
GPS1-223	ENST00000584229	PLA2G10	O15496	165 aa		19.52	■□□□□ 0.72
GPS1-223	ENST00000584229	NDUFB6	O95139	128 aa		19.52	■□□□□ 0.72
GPS1-223	ENST00000584229	ELANE	P08246	267 aa		19.52	■□□□□ 0.72
GPS1-223	ENST00000584229	OR9G9	P0C7N8	305 aa		19.52	■□□□□ 0.72
GPS1-223	ENST00000584229	ANXA3	P12429	323 aa		19.52	■□□□□ 0.72
GPS1-223	ENST00000584229	VAMP1	P23763	118 aa		19.52	■□□□□ 0.72
GPS1-223	ENST00000584229	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	19.52	■□□□□ 0.72
GPS1-223	ENST00000584229	BTC	P35070	178 aa		19.52	■□□□□ 0.72
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF695	Q8IW36	515 aa		19.52	■□□□□ 0.72
GPS1-223	ENST00000584229	COA4	Q9NYJ1	87 aa		19.52	■□□□□ 0.72
GPS1-223	ENST00000584229	PRR13	Q9NZ81	148 aa		19.52	■□□□□ 0.72
GPS1-223	ENST00000584229	UPK1B	O75841	260 aa		19.51	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		19.51	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		19.51	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	OR4A16	Q8NH70	328 aa		19.51	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	19.51	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	MS4A10	Q96PG2	267 aa		19.51	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	TSC22D3	Q99576	134 aa		19.51	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	HINT2	Q9BX68	163 aa		19.51	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	HMX3	A6NHT5	357 aa		19.5	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		19.5	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		19.5	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		19.5	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		19.5	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	SOX15	O60248	233 aa		19.49	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	PSMB8	P28062	276 aa		19.49	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	19.49	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		19.49	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		19.49	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		19.49	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		19.49	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		19.49	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	19.49	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM68	Q96MH6	324 aa		19.49	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	PRND	Q9UKY0	176 aa		19.49	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		19.49	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	TSPAN15	O95858	294 aa		19.48	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	IGKV1-5	P01602	117 aa		19.48	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	IGLV1-40	P01703	118 aa		19.48	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	TPPP2	P59282	170 aa		19.48	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM187	Q14656	261 aa		19.48	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		19.48	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	GALNT14	Q96FL9	552 aa		19.48	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	KLK15	Q9H2R5	256 aa		19.48	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	DNHD1	Q96M86	4753 aa		19.48	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	C15orf61	A6NNL5	157 aa		19.47	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229		E7EUB6	86 aa		19.47	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	CDS2	O95674	445 aa		19.47	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	TRGV3	P03979	118 aa		19.47	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	19.47	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	RAB9A	P51151	201 aa		19.47	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	19.47	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		19.47	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	19.47	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	19.47	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	19.47	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		19.47	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	ZFP57	Q9NU63	452 aa		19.47	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		19.47	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		19.46	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		19.46	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	TEX22	C9J3V5	150 aa		19.46	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	REG1A	P05451	166 aa		19.46	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	19.46	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	PPP1R1A	Q13522	171 aa		19.46	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		19.46	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		19.46	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		19.46	■□□□□ 0.71
GPS1-223	ENST00000584229	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		19.45	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		19.45	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		19.45	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		19.45	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	SRPX	P78539	464 aa		19.45	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	DEFA5	Q01523	94 aa		19.45	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	ASAH1	Q13510	395 aa		19.45	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		19.45	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	LGI3	Q8N145	548 aa		19.45	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	SLC35G3	Q8N808	338 aa		19.45	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		19.45	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	OR5B12	Q96R08	314 aa		19.45	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	OR4F4	Q96R69	305 aa		19.45	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		19.45	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1B0GW64	132 aa		19.44	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	19.44	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	AREG	P15514	252 aa		19.44	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	19.44	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	RAB25	P57735	213 aa		19.44	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	C4orf46	Q504U0	113 aa		19.44	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	CADM3	Q8N126	398 aa		19.44	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	RNF152	Q8N8N0	203 aa		19.44	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	ENKUR	Q8TC29	256 aa		19.44	■□□□□ 0.7
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM56	Q96MV1	263 aa		19.44	■□□□□ 0.7

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