RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 FBXL12Q9NXK8 326 aa4.03□□□□□ -1.76
TSG101-211ENST00000580814 TVP23BQ9NYZ1 205 aa4.03□□□□□ -1.76
TSG101-211ENST00000580814 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
TSG101-211ENST00000580814 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa4.02□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa4.02□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.02□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 J3QQQ9 107 aa4.02□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 DEDDO75618 318 aa4.02□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 IGHV3-48P01763 117 aa4.02□□□□□ -1.77
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TSG101-211ENST00000580814 CHTF8P0CG12 524 aa4.02□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 LINC00694P0DN24 101 aa4.02□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 IMPA1P29218 277 aa4.02□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 OR10J1P30954 320 aa4.02□□□□□ -1.77
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TSG101-211ENST00000580814 CRADDP78560 199 aa4.02□□□□□ -1.77
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TSG101-211ENST00000580814 MDP1Q86V88 176 aa4.02□□□□□ -1.77
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TSG101-211ENST00000580814 OR52R1Q8NGF1 315 aa4.02□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 TMEM106AQ96A25 262 aa4.02□□□□□ -1.77
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TSG101-211ENST00000580814 C18orf15Q96N68 181 aa4.02□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 YPEL4Q96NS1 127 aa4.02□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 NRIP2Q9BQI9 281 aa4.02□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 PHLPP1O60346 1717 aa4.01□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa4.01□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa4.01□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 GABARAPH6UMI1 98 aa4.01□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 SCO1O75880 301 aa4.01□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 SERF1AO75920 110 aa4.01□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 SNAPC5O75971 98 aa4.01□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa4.01□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa4.01□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 LINC00313P59037 77 aa4.01□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 CDK6Q00534 326 aa4.01□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 CAV1Q03135 178 aa4.01□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 BCL2L15Q5TBC7 163 aa4.01□□□□□ -1.77
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TSG101-211ENST00000580814 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 REREQ9P2R6 1566 aa4.01□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 WDR62O43379 1518 aa4□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 ERICH3Q5RHP9 1530 aa4□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa4□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 LST1O00453 97 aa4□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 INAFM2P0DMQ5 153 aa4□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 OPRK1P41145 380 aa4□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 GNG4P50150 75 aa4□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP4□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 ORMDL2Q53FV1 153 aa4□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 WDR86Q86TI4 376 aa4□□□□□ -1.77
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TSG101-211ENST00000580814 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 ZNF664Q8N3J9 261 aa4□□□□□ -1.77
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TSG101-211ENST00000580814 OR2M3Q8NG83 312 aa4□□□□□ -1.77
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TSG101-211ENST00000580814 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa4□□□□□ -1.77
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TSG101-211ENST00000580814 OR2A5Q96R48 311 aa4□□□□□ -1.77
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TSG101-211ENST00000580814 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 NAV1Q8NEY1 1877 aa3.99□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 TMEM212A6NML5 194 aa3.99□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 A8MUN3 132 aa3.99□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 COX7A2LO14548 114 aa3.99□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 NPFFO15130 113 aa3.99□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 SLC37A4O43826 429 aa3.99□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 LY6G6DO95868 133 aa3.99□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 GPX1P07203 203 aa3.99□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 S100A2P29034 98 aa3.99□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 RBMXP38159 391 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 INPP1P49441 399 aa3.99□□□□□ -1.77
TSG101-211ENST00000580814 HERVK_113P61574 105 aa3.99□□□□□ -1.77
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