RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 MLXQ9UH92 298 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM213A2RRL7 107 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 DHFRP00374 187 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 GHRHP01286 108 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 ALPLP05186 524 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 GNAO1P09471 354 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 OR4E1P0C645 316 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 G0S2P27469 103 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 HLA-DRB3P79483 266 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 PRSS8Q16651 343 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 HES5Q5TA89 166 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 OR4A47Q6IF82 309 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 BTNL8Q6UX41 500 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 TEX45Q8NA69 505 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 RAB24Q969Q5 203 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 CDIP1Q9H305 208 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 PRR13Q9NZ81 148 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 PKHD1P08F94 4074 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1W2PPV4 95 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 EI24O14681 340 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 XRCC3O43542 346 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3-23P01764 117 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 SCTP09683 121 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 CD3GP09693 182 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 UBBP0CG47 229 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 RRASP10301 218 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 HTR2CP28335 458 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 TCTAP57738 103 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 UBE2KP61086 200 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 RTL8BQ17RB0 113 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 C1orf146Q5VVC0 180 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 OR10K2Q6IF99 312 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 SPIN2AQ99865 258 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 RDH8Q9NYR8 311 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1B0GVY2 172 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 A8MWP6 167 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 NQO2P16083 231 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 DCKP27707 260 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF585BQ52M93 769 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 MARC2Q969Z3 335 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 NICN1Q9BSH3 213 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 OR2D2Q9H210 308 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 AK3Q9UIJ7 227 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 DPPA5A6NC42 116 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 IGLL5B9A064 214 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 BET1O15155 118 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 DFFBO76075 338 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 LALBAP00709 142 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 MYL12AP19105 171 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 MALP21145 153 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 TPBGQ13641 420 aa6.73□□□□□ -1.33
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