RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578896.1

GGA3-207, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene GGA3, Length 439 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-207ENST00000578896 ARL6IP1Q15041 203 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 ZNF585BQ52M93 769 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 IDNKQ5T6J7 187 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 GPHB5Q86YW7 130 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 BEST4Q8NFU0 473 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 CENPOQ9BU64 300 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 VCX3BQ9H321 246 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 SSR3Q9UNL2 185 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 ERICH4A6NGS2 130 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 LGALS9O00182 355 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 SLC22A5O76082 557 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 JTBO76095 146 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 S1PR2O95136 353 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 HRASP01112 189 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 PPYP01298 95 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 GALP22466 123 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 GPR183P32249 361 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 MAS1LP35410 378 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 TGFBR1P36897 503 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 HSPA13P48723 471 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 OR2B8PP59922 312 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 GABARAPL2P60520 117 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 TMEM17Q86X19 198 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 HOGA1Q86XE5 327 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 LAX1Q8IWV1 398 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 OR51H1Q8NH63 302 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 RAB26Q9ULW5 256 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 UPK2O00526 184 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 PMS2P11Q13670 270 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 FAM209BQ5JX69 171 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 TPRA1Q86W33 373 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 TMEM140Q9NV12 185 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 BET1LQ9NYM9 111 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 NSG2Q9Y328 171 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 SCGNO76038 276 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 DHFRP00374 187 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 MFAP2P55001 183 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 NEDD8Q15843 81 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 KLK9Q2XQG4 91 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 PLET1Q6UQ28 207 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 IL17DQ8TAD2 202 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 HINT2Q9BX68 163 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 AGRNO00468 2067 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 A0A0J9YWU9 116 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 OR2T8A6NH00 312 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 A8MWP6 167 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 ATP6V1G2O95670 118 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 HPRT1P00492 218 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 PMP2P02689 132 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 C8orf88P0DMB2 117 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 OR13C7P0DN81 318 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 NQO2P16083 231 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 GNRHRP30968 328 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 RFX2P48378 723 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 TAS2R31P59538 309 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 WT1-ASQ06250 92 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 CATR1Q13166 79 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 OR4A5Q8NH83 315 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 CXorf58Q96LI9 332 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-207ENST00000578896 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.65□□□□□ -1.34
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