RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	OR5B3	Q8NH48	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	PIFO	Q8TCI5	191 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	TNC	P24821	2201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965		A0A1B0GUS0	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965		A0A1W2PRD5	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965		A0A1W2PRF3	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965		A0A1W2PRM7	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965		H3BUX3	64 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	MED6	O75586	246 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SNAPC5	O75971	98 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	ACTL6B	O94805	426 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	CRYGB	P07316	175 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965		P0C879	139 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	PET100	P0DJ07	73 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	PSG5	Q15238	335 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965		Q6ZNX1	250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	C17orf50	Q8WW18	174 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SMR3A	Q99954	134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	NMES1	Q9C002	83 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	OR51J1	Q9H342	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965		A0A1W2PN81	502 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	UPK2	O00526	184 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	CYB5B	O43169	146 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SSNA1	O43805	119 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	S1PR2	O95136	353 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	BRI3	O95415	125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	KRAS	P01116	189 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	IGHG2	P01859	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	IGF1	P05019	195 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	G6PC	P35575	357 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	CHRNA7	P36544	502 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	FGL1	Q08830	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	PLGLA	Q15195	96 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	PRSS8	Q16651	343 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SP6	Q3SY56	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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