RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558843.5

COPS2-205, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, human

TSL 1 (best)

Gene COPS2, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS2-205	ENST00000558843	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		0.91	□□□□□ -2.26
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		0.91	□□□□□ -2.26
COPS2-205	ENST00000558843	ANKRD7	Q92527	254 aa		0.91	□□□□□ -2.26
COPS2-205	ENST00000558843	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		0.91	□□□□□ -2.26
COPS2-205	ENST00000558843	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		0.91	□□□□□ -2.26
COPS2-205	ENST00000558843	C3orf18	Q9UK00	162 aa		0.91	□□□□□ -2.26
COPS2-205	ENST00000558843	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		0.91	□□□□□ -2.26
COPS2-205	ENST00000558843	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
COPS2-205	ENST00000558843	CR1	P17927	2039 aa		0.91	□□□□□ -2.26
COPS2-205	ENST00000558843	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
COPS2-205	ENST00000558843	MPDZ	O75970	2070 aa		0.9	□□□□□ -2.26
COPS2-205	ENST00000558843	NCKAP5	O14513	1909 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843		I3L521	148 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	LST1	O00453	97 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	CETN3	O15182	167 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	LEPROT	O15243	131 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	SLC22A1	O15245	554 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	SLC16A4	O15374	487 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	REG1A	P05451	166 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	TFPT	P0C1Z6	253 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	KCNE1	P15382	129 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	MAGEA2	P43356	314 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	REG1B	P48304	166 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	CDK5R1	Q15078	307 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	FAM27B	Q5VT28	67 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	TIMM22	Q9Y584	194 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	PIK3R4	Q99570	1358 aa		0.9	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843		A0A1B0GV50	99 aa		0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	LRRN3	E7EW58	273 aa		0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	CXCR6	O00574	342 aa		0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	C1QA	P02745	245 aa		0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	CCL5	P13501	91 aa		0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843		Q1T7F1	81 aa		0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	C1orf195	Q5TG92	126 aa		0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	FUT9	Q9Y231	359 aa		0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	WDR90	Q96KV7	1748 aa		0.89	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	IRGM	A1A4Y4	181 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	GGT3P	A6NGU5	568 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	C21orf140	B9A014	251 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843		H0Y980	276 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	DEXI	O95424	95 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	IGHV3-7	P01780	117 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	FAM228B	P0C875	321 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	CCL1	P22362	96 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	HLA-DMB	P28068	263 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	MAP2K4	P45985	399 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	MARCKSL1	P49006	195 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	DMTN	Q08495	405 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	COQ5	Q5HYK3	327 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF550	Q7Z398	422 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	LAMB2	P55268	1798 aa		0.88	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	ACOX3	O15254	700 aa		0.87	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	FGF6	P10767	208 aa		0.87	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	FXYD2	P54710	66 aa		0.87	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	NAA20	P61599	178 aa		0.87	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		0.87	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	CDK10	Q15131	360 aa		0.87	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	DHFR2	Q86XF0	187 aa		0.87	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	GID4	Q8IVV7	300 aa		0.87	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM156	Q8N614	296 aa		0.87	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	DEFB125	Q8N687	156 aa		0.87	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		0.87	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	RAB8B	Q92930	207 aa		0.87	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	CNBD2	Q96M20	576 aa		0.87	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		0.87	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		0.87	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		0.87	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	SMARCA4	P51532	1647 aa		0.86	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	FUOM	A2VDF0	154 aa		0.86	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		0.86	□□□□□ -2.27
COPS2-205	ENST00000558843	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27

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