RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 HLA-GP17693 338 aa6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 FCGR2CP31995 323 aa6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 ARPC4P59998 168 aa6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 MSMO1Q15800 293 aa6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 KLK9Q2XQG4 91 aa6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 OR4A47Q6IF82 309 aa6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 BEST4Q8NFU0 473 aa6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 CCDC140Q96MF4 163 aa6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 THYN1Q9P016 225 aa6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 RAB26Q9ULW5 256 aa6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 S4R3C0 116 aa6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 A0A1B0GW64 132 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 CYB5BO43169 146 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 TNFSF12O43508 249 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 REG1AP05451 166 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 PSMB9P28065 219 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 GABARAPL2P60520 117 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 ZNF585BQ52M93 769 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 TM4SF20Q53R12 229 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 SPARTQ8N0X7 666 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 FCGR1BQ92637 280 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 MARC2Q969Z3 335 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 GPHA2Q96T91 129 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 DIABLOQ9NR28 239 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 RHBDL2Q9NX52 303 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 BET1LQ9NYM9 111 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 MLXQ9UH92 298 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.12□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 A0A0A6YYH2 397 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 TMEM213A2RRL7 107 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 A6NJ64 397 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 A8MWP6 167 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 SULT1C2O00338 296 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 UPK2O00526 184 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 HPRT1P00492 218 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 PPYP01298 95 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 C8orf88P0DMB2 117 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 MYOD1P15172 320 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 NQO2P16083 231 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 EDN2P20800 178 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 SDC2P34741 201 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 SCAND1P57086 179 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 TAS2R31P59538 309 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 OR2B8PP59922 312 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 MXD1Q05195 221 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 CATR1Q13166 79 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 IDNKQ5T6J7 187 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 PLET1Q6UQ28 207 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 HOGA1Q86XE5 327 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 BORCS5Q969J3 196 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.11□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.1□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.1□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 CGB1A6NKQ9 187 aa6.1□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 FGF2P09038 288 aa6.1□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.1□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.1□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 PTHLHP12272 177 aa6.1□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 GPR183P32249 361 aa6.1□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 CBX5P45973 191 aa6.1□□□□□ -1.43
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