RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 APOC4P55056 127 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-214ENST00000548849 TNFRSF9Q07011 255 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-214ENST00000548849 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
CS-214ENST00000548849 DEFB135Q30KP9 77 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-214ENST00000548849 ZNF66Q6ZN08 573 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-214ENST00000548849 WFDC3Q8IUB2 231 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-214ENST00000548849 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-214ENST00000548849 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-214ENST00000548849 UFC1Q9Y3C8 167 aa12.65□□□□□ -0.38
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CS-214ENST00000548849 Q6ZWC4 215 aa12.64□□□□□ -0.39
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CS-214ENST00000548849 ANXA10Q9UJ72 324 aa12.64□□□□□ -0.39
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CS-214ENST00000548849 BET1LQ9NYM9 111 aa12.63□□□□□ -0.39
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CS-214ENST00000548849 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
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CS-214ENST00000548849 STPG3Q8N7X2 389 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-214ENST00000548849 SECTM1Q8WVN6 248 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-214ENST00000548849 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
CS-214ENST00000548849 CCL28Q9NRJ3 127 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-214ENST00000548849 NDUFB11Q9NX14 153 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-214ENST00000548849 SSX5O60225 188 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-214ENST00000548849 RPA2P15927 270 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-214ENST00000548849 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP12.61□□□□□ -0.39
CS-214ENST00000548849 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-214ENST00000548849 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
CS-214ENST00000548849 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
CS-214ENST00000548849 COMMD5Q9GZQ3 224 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-214ENST00000548849 TRAV3A0A0B4J244 114 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-214ENST00000548849 IGLC7A0M8Q6 106 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-214ENST00000548849 TSPAN4O14817 238 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-214ENST00000548849 TGOLN2O43493 480 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-214ENST00000548849 SCGNO76038 276 aa12.6□□□□□ -0.39
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CS-214ENST00000548849 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-214ENST00000548849 OR2T8A6NH00 312 aa12.59□□□□□ -0.39
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CS-214ENST00000548849 PTHLHP12272 177 aa12.59□□□□□ -0.39
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CS-214ENST00000548849 SLC25A24Q6NUK1 477 aa12.59□□□□□ -0.39
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CS-214ENST00000548849 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-214ENST00000548849 TMEM190Q8WZ59 177 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-214ENST00000548849 DAPK2Q9UIK4 370 aa12.59□□□□□ -0.39
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CS-214ENST00000548849 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-214ENST00000548849 SLC5A7Q9GZV3 580 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-214ENST00000548849 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-214ENST00000548849 HERC2O95714 4834 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-214ENST00000548849 OR4C46A6NHA9 309 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-214ENST00000548849 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP12.57□□□□□ -0.4
CS-214ENST00000548849 DEDDO75618 318 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-214ENST00000548849 PPYP01298 95 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-214ENST00000548849 GVQW1Q8N7I0 195 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-214ENST00000548849 GALNT14Q96FL9 552 aa12.57□□□□□ -0.4
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