RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 CST7O76096 145 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 KRASP01116 189 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZVH6 145 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 PCSK5Q92824 1860 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 AKAP13Q12802 2813 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 MSGN1A6NI15 193 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 KITLGP21583 273 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 TIMM23BQ5SRD1 257 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 LIME1Q9H400 295 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 NSG2Q9Y328 171 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 WIPI2Q9Y4P8 454 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 HELTA6NFD8 242 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 MSTNO14793 375 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 TAAR5O14804 337 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 FAM201AQ5SY85 155 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZN92 141 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 WDR31Q8NA23 367 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 RND1Q92730 232 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 OR2D2Q9H210 308 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1B0GW64 132 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 IQCF6A8MYZ5 107 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 RND2P52198 227 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 PLP1P60201 277 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 CATR1Q13166 79 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 TM4SF20Q53R12 229 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ASCL4Q6XD76 172 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 FAM57AQ8TBR7 257 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ITLN1Q8WWA0 313 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 TVP23CQ96ET8 276 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 IMMP2LQ96T52 175 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 FBXL17Q9UF56 701 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 RAXQ9Y2V3 346 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 CLDN34H7C241 214 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV3-15P01624 115 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 MIDNQ504T8 468 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 MOB1BQ7L9L4 216 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00596Q86U02 117 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 OR1L1Q8NH94 360 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 CCL17Q92583 94 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 DKK4Q9UBT3 224 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 FUT9Q9Y231 359 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 H0YIZ8 118 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 CDS2O95674 445 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 IAPPP10997 89 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 PSG2P11465 335 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 PRDX2P32119 198 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 PPOXP50336 477 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 PAFAH1B2P68402 229 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 LFNGQ8NES3 379 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 MLNRO43193 412 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 JTBO76095 146 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 CLDN1O95832 211 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 VDAC1P21796 283 aa6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms