RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa12.71□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 FAM106AQ4KMX7 169 aa12.71□□□□□ -0.37
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HERC3-211ENST00000513325 SPAG16Q8N0X2 631 aa12.71□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 FCGR1BQ92637 280 aa12.71□□□□□ -0.37
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HERC3-211ENST00000513325 BET1LQ9NYM9 111 aa12.71□□□□□ -0.37
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HERC3-211ENST00000513325 SLC25A38Q96DW6 304 aa12.7□□□□□ -0.38
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HERC3-211ENST00000513325 A6NJ64 397 aa12.66□□□□□ -0.38
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF585BQ52M93 769 aa12.66□□□□□ -0.38
HERC3-211ENST00000513325 TMEM17Q86X19 198 aa12.66□□□□□ -0.38
HERC3-211ENST00000513325 OR51H1Q8NH63 302 aa12.66□□□□□ -0.38
HERC3-211ENST00000513325 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
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HERC3-211ENST00000513325 TMEM140Q9NV12 185 aa12.66□□□□□ -0.38
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HERC3-211ENST00000513325 S1PR2O95136 353 aa12.65□□□□□ -0.38
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HERC3-211ENST00000513325 RPA2P15927 270 aa12.65□□□□□ -0.38
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD55Q3KP44 614 aa12.65□□□□□ -0.38
HERC3-211ENST00000513325 AADACL3Q5VUY0 350 aa12.65□□□□□ -0.38
HERC3-211ENST00000513325 PLET1Q6UQ28 207 aa12.65□□□□□ -0.38
HERC3-211ENST00000513325 DMBX1Q8NFW5 382 aa12.65□□□□□ -0.38
HERC3-211ENST00000513325 OR5AP2Q8NGF4 316 aa12.65□□□□□ -0.38
HERC3-211ENST00000513325 OR10W1Q8NGF6 305 aa12.65□□□□□ -0.38
HERC3-211ENST00000513325 GIMAP1Q8WWP7 306 aa12.65□□□□□ -0.38
HERC3-211ENST00000513325 MARC2Q969Z3 335 aa12.65□□□□□ -0.38
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HERC3-211ENST00000513325 PLEKHA2Q9HB19 425 aa12.65□□□□□ -0.38
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HERC3-211ENST00000513325 OVOL2Q9BRP0 275 aa12.64□□□□□ -0.39
HERC3-211ENST00000513325 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
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HERC3-211ENST00000513325 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
HERC3-211ENST00000513325 GNRHRP30968 328 aa12.63□□□□□ -0.39
HERC3-211ENST00000513325 CBX5P45973 191 aa12.63□□□□□ -0.39
HERC3-211ENST00000513325 ELLP55199 621 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
HERC3-211ENST00000513325 NEDD8Q15843 81 aa12.63□□□□□ -0.39
HERC3-211ENST00000513325 OR1L6Q8NGR2 347 aa12.63□□□□□ -0.39
HERC3-211ENST00000513325 CD300LFQ8TDQ1 290 aa12.63□□□□□ -0.39
HERC3-211ENST00000513325 UFC1Q9Y3C8 167 aa12.63□□□□□ -0.39
HERC3-211ENST00000513325 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa12.62□□□□□ -0.39
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