RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COMMD9Q9P000 198 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DMRT1Q9Y5R6 373 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CGB1A6NKQ9 187 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GGCTO75223 188 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AREGP15514 252 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 F2RP25116 425 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR2B8PP59922 312 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LCN12Q6JVE5 192 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CMTM1Q8IZ96 169 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 Q8N402 240 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COMMD5Q9GZQ3 224 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STAB2Q8WWQ8 2551 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NDUFB8O95169 186 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DEFA4P12838 97 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LPCAT3Q6P1A2 487 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPHB5Q86YW7 130 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SGPP2Q8IWX5 399 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DMBX1Q8NFW5 382 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM140Q9NV12 185 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C19orf73Q9NVV2 129 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAV3A0A0B4J244 114 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LGALS9O00182 355 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPR31O00270 319 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 S1PR2O95136 353 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYOD1P15172 320 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ELK1P19419 428 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HLA-DMAP28067 261 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HRH1P35367 487 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MZT2AQ6P582 158 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CXorf58Q96LI9 332 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGLC7A0M8Q6 106 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RLN1P04808 185 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LPAR6P43657 344 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERVK-16P61578 105 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSPAN5P62079 268 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CTF1Q16619 201 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C19orf35Q6ZS72 473 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AP3S1Q92572 193 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC140Q96MF4 163 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZMAT4Q9H898 229 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 THYN1Q9P016 225 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MARCH11A6NNE9 402 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP5D1E7EU14 171 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HPGDSO60760 199 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TPPPO94811 219 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GABARAPO95166 117 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR2C1O95371 312 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 REG1AP05451 166 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAPPC2P0DI81 140 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAPPC2BP0DI82 140 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 S100GP29377 79 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RCVRNP35243 200 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARL3P36405 182 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UCP3P55916 312 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF585BQ52M93 769 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GTSCR1Q86UQ5 136 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FCAMRQ8WWV6 532 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RCHY1Q96PM5 261 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYB5BO43169 146 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMIM18P0DKX4 95 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM106AQ4KMX7 169 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLEC19AQ6UXS0 136 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SNX29P2Q8IUI4 249 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LAX1Q8IWV1 398 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR1L8Q8NGR8 309 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TM2D3Q9BRN9 247 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FXYD6Q9H0Q3 95 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IZUMO1RA6ND01 250 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C2orf70A6NJV1 201 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C3orf84H3BNL1 204 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRASP01116 189 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGHV3-23P01764 117 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLEC3BP05452 202 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SERPINE2P07093 398 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOLR2P14207 255 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP12.74□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DEFB114Q30KQ6 69 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FKBP11Q9NYL4 201 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms