RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512392.5

CHD1-208, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene CHD1, Length 1,968 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD1-208	ENST00000512392	RNF175	Q8N4F7	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	GABARAP	O95166	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392		P0DMU3	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	FAM231A	P0DMU4	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	FAM231C	P0DMU5	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	TDGF1	P13385	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	PGAM2	P15259	253 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	OPRM1	P35372	400 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	HERVK_113	P61574	105 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	PP6455	Q8WZ26	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	SNX12	Q9UMY4	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	NEO1	Q92859	1461 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392		A0A0J9YXY3	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392		J3QR89	54 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	SLC37A4	O43826	429 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	SNAPC5	O75971	98 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	IGKV1D-12	P01611	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	GPX1	P07203	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF823	P16415	610 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	CRISP2	P16562	243 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	TEX37	Q96LM6	180 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	LEUTX	A8MZ59	168 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	MPC2	O95563	127 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	LTA	P01374	205 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	MAS1	P04201	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	MSMO1	Q15800	293 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	SPIN2A	Q99865	258 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	DISP2	A7MBM2	1401 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	ARHGEF11	O15085	1522 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	GGT3P	A6NGU5	568 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	LYZL6	O75951	148 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	PAEP	P09466	180 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	LINC00869	P0C866	280 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	AKAIN1	P0CW23	69 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	HLA-E	P13747	358 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	CA7	P43166	264 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	GNG4	P50150	75 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	MAL2	Q969L2	176 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	MED14	O60244	1454 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	PZP	P20742	1482 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	GRIN2A	Q12879	1464 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	TMEM72	A0PK05	275 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	IFITM5	A6NNB3	132 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392		H0YJW9	148 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	PLA2G10	O15496	165 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	APOD	P05090	189 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	NFYB	P25208	207 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	BRS3	P32247	399 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392		Q8NBF4	154 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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