RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503501.1

SENP6-212, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 2,041 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-212ENST00000503501 C21orf59P57076 290 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 RAB14P61106 215 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 SLC35B1P78383 322 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 DNAJC3Q13217 504 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 PDE6HQ13956 83 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 MIAQ16674 131 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 LRRC26Q2I0M4 334 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 AMTNQ6UX39 209 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 C10orf107Q8IVU9 208 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 CMTM8Q8IZV2 173 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 DAND5Q8N907 189 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 TMEM75Q8N9X5 138 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 OR5D18Q8NGL1 313 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 AKR7LQ8NHP1 331 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 ZNF675Q8TD23 568 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 CASTOR1Q8WTX7 329 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 NELFBQ8WX92 580 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 TESCQ96BS2 214 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 RASD2Q96D21 266 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 VAT1Q99536 393 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 OR2AG1Q9H205 316 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 BLZF1Q9H2G9 400 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 ACOT13Q9NPJ3 140 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 ACER3Q9NUN7 267 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 TMEM14CQ9P0S9 112 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 TTC21AQ8NDW8 1320 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 A0A087WSZ3 146 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 A0A0J9YW62 118 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 SMIM9A6NGZ8 99 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 B4DEV8 164 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 CCL25O15444 150 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 ZMPSTE24O75844 475 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 DNAL4O96015 105 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 TFPTP0C1Z6 253 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 CCL4P13236 92 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 IVDP26440 423 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 GABRR2P28476 465 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 CA5AP35218 305 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 ACTR1BP42025 376 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 RPS5P46782 204 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 GABRA2P47869 451 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 PSMB3P49720 205 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 RAB25P57735 213 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 GABARAPL2P60520 117 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 ACTBP60709 375 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 RAB4BP61018 213 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 TSPAN5P62079 268 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 ACTG1P63261 375 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 SPAG1Q07617 926 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 LRRC74AQ0VAA2 488 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 RAB31Q13636 194 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 MAPK14Q16539 360 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 BEX5Q5H9J7 111 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 LPCAT4Q643R3 524 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 CASC1Q6TDU7 716 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 SSX9Q7RTT3 188 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 TMEM86AQ8N2M4 240 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 SPICQ8N5J4 248 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 DEFB123Q8N688 67 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 SFRP2Q96HF1 295 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 GSDMAQ96QA5 445 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 CHID1Q9BWS9 393 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 PKIBQ9C010 78 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 YIPF3Q9GZM5 350 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 OR51E2Q9H255 320 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 ARMC7Q9H6L4 198 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 AHSPQ9NZD4 102 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 GCNT4Q9P109 453 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 TAAR3PQ9P1P4 343 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 TP73-AS1Q9UF72 201 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 BAIAP2Q9UQB8 552 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-0.58□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa-0.58□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa-0.58□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 GOLGA8OA6NCC3 632 aa-0.58□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 TVP23AA6NH52 213 aa-0.58□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 LRRIQ4A6NIV6 560 aa-0.58□□□□□ -2.5
SENP6-212ENST00000503501 TRIM64CA6NLI5 447 aa-0.58□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms