RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 IGLV2-23P01705 113 aa8.65□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 CD1BP29016 333 aa8.65□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 UBE2E1P51965 193 aa8.65□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 LGALS4P56470 323 aa8.65□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 OR2B8PP59922 312 aa8.65□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 NHLH2Q02577 135 aa8.65□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 VMA21Q3ZAQ7 101 aa8.65□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.65□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 VSTM2AQ8TAG5 236 aa8.65□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 DTD1Q8TEA8 209 aa8.65□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 RNF5Q99942 180 aa8.65□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 LPAR2Q9HBW0 351 aa8.65□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.65□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 FKBP11Q9NYL4 201 aa8.65□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.65□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A096LNT2 108 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 B4DSR2 109 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 JTBO76095 146 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 KBTBD11O94819 623 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 SPDEFO95238 335 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 MSMBP08118 114 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 FGF2P09038 288 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 SULT1A1P50225 295 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 STX12Q86Y82 276 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 BAP18Q8IXM2 172 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 TEX45Q8NA69 505 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 SCARB1Q8WTV0 552 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 CLCC1Q96S66 551 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 NUP50Q9UKX7 468 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 TCF19Q9Y242 345 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa8.64□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 WNK2Q9Y3S1 2297 aa8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAV20A0A0B4J274 112 aa8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A1W2PRD5 423 aa8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A1W2PRF3 423 aa8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A1W2PRM7 423 aa8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 TIMM23O14925 209 aa8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 PDZD9Q8IXQ8 264 aa8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 UBAC2Q8NBM4 344 aa8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 OR1S2Q8NGQ3 325 aa8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 CFHR4Q92496 578 aa8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 MALSU1Q96EH3 234 aa8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 WFDC1Q9HC57 220 aa8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 OR51B2Q9Y5P1 312 aa8.63□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 H3BP45 60 aa8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 DFFBO76075 338 aa8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 CST7O76096 145 aa8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 VENTXO95231 258 aa8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 CRYGBP07316 175 aa8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 GATA3P23771 443 aa8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 DYNLT3P51808 116 aa8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 RPL8P62917 257 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 RPP30P78346 268 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 NDUFA5Q16718 116 aa8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 SPINK9Q5DT21 86 aa8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 ALKAL2Q6UX46 152 aa8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 STPG2Q8N412 459 aa8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC01356Q8N9X3 169 aa8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 OR5B3Q8NH48 314 aa8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 RITA1Q96K30 269 aa8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 OR4C12Q96R67 309 aa8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 ARV1Q9H2C2 271 aa8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 HIPK2Q9H2X6 1198 aa8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 ENY2Q9NPA8 101 aa8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 AUP1Q9Y679 476 aa8.62□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 CUBNO60494 3623 aa8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 NPFFO15130 113 aa8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC25A17O43808 307 aa8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 MAS1LP35410 378 aa8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 HTR2BP41595 481 aa8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms