RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 TUBA4BQ9H853 241 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 LCE6AA0A183 80 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 A8MZ25 164 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 RLN1P04808 185 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 CTRB1P17538 263 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 HLA-GP17693 338 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 CBLN1P23435 193 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 GPR183P32249 361 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 ARL3P36405 182 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 OR2B8PP59922 312 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 LCN12Q6JVE5 192 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 BTNL8Q6UX41 500 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 TPRA1Q86W33 373 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 Q8N402 240 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM68Q96MH6 324 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 SPIN2AQ99865 258 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 DPPA5A6NC42 116 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 OR11H12B2RN74 326 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 H0Y980 276 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 UPK2O00526 184 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV3-48P01763 117 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 CRYGCP07315 174 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 CTXN2P0C2S0 81 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 GNRHRP30968 328 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 KIR2DS2P43631 304 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 WT1-ASQ06250 92 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF124Q15973 351 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 FCGR1BQ92637 280 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 ISOC1Q96CN7 298 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 SPATA25Q9BR10 227 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM140Q9NV12 185 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 EHFQ9NZC4 300 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 PEMTQ9UBM1 199 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 F8W735 103 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 TPPPO94811 219 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 CLEC3BP05452 202 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 G6PCP35575 357 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 TAS2R20P59543 309 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 NCS1P62166 190 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 TATDN3Q17R31 274 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF585BQ52M93 769 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 SPINK9Q5DT21 86 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 YIPF6Q96EC8 236 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 HINT2Q9BX68 163 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 ETV7Q9Y603 341 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 OR2T8A6NH00 312 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 KRASP01116 189 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 OR13C7P0DN81 318 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 DEFA4P12838 97 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 HLA-DMAP28067 261 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 LPAR6P43657 344 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 BET1LQ9NYM9 111 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC3-211ENST00000491581 LGALS9O00182 355 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC3-211ENST00000491581 XRCC3O43542 346 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC3-211ENST00000491581 AIREO43918 545 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC3-211ENST00000491581 HRASP01112 189 aa6.64□□□□□ -1.35
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