RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 S4R3C0 116 aa12.43□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF320A2RRD8 509 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP12.42□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 CLEC3BP05452 202 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 DEFA4P12838 97 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 MYOD1P15172 320 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 SCAND1P57086 179 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 ARPC4P59998 168 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 ANKRD55Q3KP44 614 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 SPARTQ8N0X7 666 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 BEST4Q8NFU0 473 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 OR52B4Q8NGK2 314 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 LGALS14Q8TCE9 139 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 SSR3Q9UNL2 185 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 TRAV25A0A0B4J276 109 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 MFSD2BA6NFX1 497 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 TNFSF12O43508 249 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 C8orf88P0DMB2 117 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 PSMB9P28065 219 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 FCGR2CP31995 323 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 POU2AF1Q16633 256 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 HOGA1Q86XE5 327 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 SPAG16Q8N0X2 631 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 OR13F1Q8NGS4 319 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 SECTM1Q8WVN6 248 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 FCGR1BQ92637 280 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 MARC2Q969Z3 335 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 A0A0A6YYH2 397 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 A6NJ64 397 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 HPRT1P00492 218 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 PPYP01298 95 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 REG1AP05451 166 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 FGF2P09038 288 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 ELLP55199 621 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 TAS2R31P59538 309 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 OR2B8PP59922 312 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 TM4SF20Q53R12 229 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 GVQW1Q8N7I0 195 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF502Q8TBZ5 544 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 OVOL2Q9BRP0 275 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 GGTLC1Q9BX51 225 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 HRASLSQ9HDD0 168 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 ETV7Q9Y603 341 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 SELENOKQ9Y6D0 94 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP4-210ENST00000489601 TRAV18A0A075B6X5 111 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 IGLC7A0M8Q6 106 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 UPK2O00526 184 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 PTHLHP12272 177 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 NQO2P16083 231 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 SDC2P34741 201 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 CATR1Q13166 79 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF773Q6PK81 442 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 BTNL8Q6UX41 500 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa12.39□□□□□ -0.43
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SH3BP4-210ENST00000489601 SLC25A38Q96DW6 304 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC5A7Q9GZV3 580 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 THYN1Q9P016 225 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 TRAV3A0A0B4J244 114 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 SULT1C2O00338 296 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 CD300LFQ8TDQ1 290 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 GIMAP1Q8WWP7 306 aa12.38□□□□□ -0.43
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SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 COMMD5Q9GZQ3 224 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 PLEKHA2Q9HB19 425 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 UFC1Q9Y3C8 167 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 CLEC2LP0C7M8 214 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 GPR183P32249 361 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 MXD1Q05195 221 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF585BQ52M93 769 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 PLET1Q6UQ28 207 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 OR1L6Q8NGR2 347 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 VN1R17PQ8TDU5 208 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 AUNIPQ9H7T9 357 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 CYB5BO43169 146 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 CBX5P45973 191 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 FXYD4P59646 89 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 WFDC3Q8IUB2 231 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 OR2C3Q8N628 320 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 OR5AP2Q8NGF4 316 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 C5orf66Q9H5L9 145 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 DIABLOQ9NR28 239 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM140Q9NV12 185 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 TGOLN2O43493 480 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM127O75204 238 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 IDNKQ5T6J7 187 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC38A6Q8IZM9 456 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP4-210ENST00000489601 DMBX1Q8NFW5 382 aa12.35□□□□□ -0.43
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