RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 CD79AP11912 226 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 LCN1P31025 176 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 GGT2P36268 569 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 ARR3P36575 388 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB13P51153 203 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 ARF6P62330 175 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 RPL38P63173 70 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 PSPHP78330 225 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC35A1P78382 337 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 PSG4Q00888 419 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 IL18Q14116 193 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 HIST3H3Q16695 136 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 HSP90B2PQ58FF3 399 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 YIF1BQ5BJH7 314 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 STUMQ69YW2 141 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF826PQ6ZT77 177 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 PAGE2Q7Z2X7 111 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 VMO1Q7Z5L0 202 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 LY6G5BQ8NDX9 201 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC30A7Q8NEW0 376 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 RXFP4Q8TDU9 374 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB1CQ92928 201 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 ROPN1LQ96C74 230 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNS1Q96KK3 526 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 C18orf15Q96N68 181 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 C1orf50Q9BV19 199 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 CDCA4Q9BXL8 241 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM38BQ9NVV0 291 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 STK38LQ9Y2H1 464 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 TNXBP22105 4242 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 TNCP24821 2201 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 SORL1Q92673 2214 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A087WUJ7 227 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM120BA0PK00 339 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 F5H5P2 479 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 PLPP3O14495 311 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 BIRC5O15392 142 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 PLIN3O60664 434 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 OTCP00480 354 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 MT-ND4P03905 459 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 KRT16P08779 473 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 TFPTP0C1Z6 253 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00032P0C843 101 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 ANXA8P13928 327 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 HTR1DP28221 377 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 CRABP2P29373 138 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 MYCNOSP40205 109 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 PLTPP55058 493 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 VSNL1P62760 191 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 PMS2P3Q13401 168 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 CASP8Q14790 479 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC153Q494R4 210 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 SPIN4Q56A73 249 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 ANXA8L1Q5VT79 327 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC121Q6ZUS5 278 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 SSX8Q7RTT4 187 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 TCF23Q7RTU1 214 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 NAA40Q86UY6 237 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFA11Q86Y39 141 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 CTAGE3PQ8IX95 158 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 MSRB3Q8IXL7 192 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 OR5AS1Q8N127 324 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC22A24Q8N4F4 322 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM216BQ8N7L0 139 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 C8orf31Q8N9H6 132 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 BPIFCQ8NFQ6 507 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 MFSD8Q8NHS3 518 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 SFXN5Q8TD22 340 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 OR5P2Q8WZ92 322 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 PPCDCQ96CD2 204 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 TLCD1Q96CP7 247 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC35G5Q96KT7 338 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 OR2V2Q96R30 315 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 PRSS27Q9BQR3 290 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 TM2D3Q9BRN9 247 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 CHCHD7Q9BUK0 85 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 C20orf27Q9GZN8 174 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 TAS2R5Q9NYW4 299 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 AHSPQ9NZD4 102 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 PSME2Q9UL46 239 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 USH1CQ9Y6N9 552 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF213Q63HN8 5207 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAV25A0A0B4J276 109 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-211ENST00000489450 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-211ENST00000489450 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa1.65□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.3 ms