RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485002.6

MEGF6-205, Transcript of multiple EGF like domains 6, human

TSL 5

Gene MEGF6, Length 4,705 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEGF6-205	ENST00000485002	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	RNF144B	Q7Z419	303 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	FABP2	P12104	132 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	DEFB124	Q8NES8	71 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	POLE	Q07864	2286 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	LYL1	P12980	280 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	CEACAM3	P40198	252 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	QRFP	P83859	136 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	HCP5	Q6MZN7	132 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	RAB37	Q96AX2	223 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	CLDN18	P56856	261 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	CD55	P08174	381 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	GNB2	P62879	340 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	FADS6	Q8N9I5	356 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	ADM	P35318	185 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	NRN1	Q9NPD7	142 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	OR4C46	A6NHA9	309 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002		A6NNC1	897 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	WNT9B	O14905	357 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002		F5H697	171 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	DLEU1	O43261	78 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	IGKV1D-12	P01611	117 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	HES7	Q9BYE0	225 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	PCSK4	Q6UW60	755 aa		13.27	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		13.27	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	NEU1	Q99519	415 aa		13.27	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		13.27	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.28
MEGF6-205	ENST00000485002	TFPI2	P48307	235 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	CCL8	P80075	99 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002		A0A1W2PRD5	423 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002		A0A1W2PRF3	423 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002		A0A1W2PRM7	423 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF146	Q15072	292 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	OR4A8	P0C604	315 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	CEACAM1	P13688	526 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	TMEM189	A5PLL7	270 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	NUDT3	O95989	172 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	CD40	P25942	277 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	HBB	P68871	147 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	KCNS1	Q96KK3	526 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	IGFBP2	P18065	325 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	GCSH	P23434	173 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	CKS2	P33552	79 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	NPIPB3	Q92617	1050 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF714	Q96N38	554 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	EFNA2	O43921	213 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	IGHV3-48	P01763	117 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	IGHV2-5	P01817	119 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	LIPF	P07098	398 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	ACACA	Q13085	2346 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002		H3BTX0	84 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	WBP1	Q96G27	269 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MEGF6-205	ENST00000485002	GUCD1	Q96NT3	240 aa		13.25	□□□□□ -0.29

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