RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 NRARPQ7Z6K4 114 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 LYG1Q8N1E2 194 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ABHD12Q8N2K0 398 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF439Q8NDP4 499 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 OR13C8Q8NGS7 320 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 OR6F1Q8NGZ6 308 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CT45A3Q8NHU0 189 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 MARCH1Q8TCQ1 289 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TNFRSF14Q92956 283 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 MRGPRFQ96AM1 343 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 C5orf30Q96GV9 206 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 LITAFQ99732 161 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CABLES2Q9BTV7 478 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 FXYD6Q9H0Q3 95 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM133Q9H2Q1 129 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 YAE1D1Q9NRH1 226 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TAS2R8Q9NYW2 309 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 OPN4Q9UHM6 478 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 MGAT4AQ9UM21 535 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 AUP1Q9Y679 476 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ABCA1O95477 2261 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 OTOGQ6ZRI0 2925 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV40A0A0B4J280 105 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1B0GU03 582 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CENPXA8MT69 81 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 M0R1W7 72 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CIDEAO60543 219 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 YPEL1O60688 119 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 DIRAS3O95661 229 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 LY6G6DO95868 133 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CSN3P07498 182 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CTXN2P0C2S0 81 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SPP1P10451 314 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CD99P14209 185 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 PGAM2P15259 253 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 PRTN3P24158 256 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CD24P25063 80 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 FAUP35544 74 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 RAB13P51153 203 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 LUMP51884 338 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 AP3S2P59780 193 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 DLK1P80370 383 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 HTD2P86397 168 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CBX3Q13185 183 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ASAH1Q13510 395 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 MEF2DQ14814 521 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SSX2Q16385 188 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 Q3ZCU0 254 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 PHLDA2Q53GA4 152 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ACTBL2Q562R1 376 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 OR2B11Q5JQS5 317 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 DHRS11Q6UWP2 260 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TMED4Q7Z7H5 227 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 DYNAPQ8N1N2 210 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 OR13D1Q8NGV5 346 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 OR10X1Q8NGY0 326 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 OR9G1Q8NH87 305 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TERB2Q8NHR7 220 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ENKURQ8TC29 256 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SSMEM1Q8WWF3 244 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 GIMAP1Q8WWP7 306 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 C18orf12Q96KH6 178 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 C17orf77Q96MU5 243 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 YPEL2Q96QA6 119 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 AGMATQ9BSE5 352 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CLEC7AQ9BXN2 247 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 OR2D2Q9H210 308 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00574Q9H8X3 128 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SDHAF2Q9NX18 166 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 JPT1Q9UK76 154 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 VSIG4Q9Y279 399 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 HILPDAQ9Y5L2 63 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 KPTNQ9Y664 436 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ACANP16112 2415 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CSPG4Q6UVK1 2322 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 NAP1L6A6NFF2 107 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 M0R1X1 148 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 NPFFO15130 113 aa3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms