RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 FKBP11Q9NYL4 201 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 METRNQ9UJH8 293 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 JPT1Q9UK76 154 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 USF3Q68DE3 2245 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 C15orf65H3BRN8 121 aa7.21□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 AGFG2O95081 481 aa7.21□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 C1QTNF9P0C862 333 aa7.21□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 PRDX2P32119 198 aa7.21□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 RAB4BP61018 213 aa7.21□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 PAX5Q02548 391 aa7.21□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 TREML4Q6UXN2 200 aa7.21□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa7.21□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.21□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 LRRC29Q8WV35 223 aa7.21□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 S1PR3Q99500 378 aa7.21□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa7.21□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.21□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 IGKV3-15P01624 115 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 TFF1P04155 84 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 BMP5P22003 454 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 FABP6P51161 128 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 LINC00205P59089 165 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 RAB31Q13636 194 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 C1orf174Q8IYL3 243 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 CLCF1Q9UBD9 225 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 FAM186AA6NE01 2351 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 HELTA6NFD8 242 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 YPEL1O60688 119 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 WISP2O76076 250 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 ATP5J2P56134 94 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 SOX8P57073 446 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 TMPRSS3P57727 454 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 MORN2Q502X0 79 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 CD177Q8N6Q3 437 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 MISP3Q96FF7 219 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 UHRF2Q96PU4 802 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 YPEL2Q96QA6 119 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 DERL1Q9BUN8 251 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 MSL2Q9HCI7 577 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 ENY2Q9NPA8 101 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 ELOVL5Q9NYP7 299 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 LOC400499M0QZD8 3231 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 RRHO14718 337 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 MGST3O14880 152 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 NDUFB7P17568 137 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 RHOBP62745 196 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 MIC13Q5XKP0 118 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 MGST2Q99735 147 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 DCTN5Q9BTE1 182 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 RAB9BQ9NP90 201 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 RAB4AP20338 218 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 OR10J1P30954 320 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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PKP4-210ENST00000480171 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 ERASQ7Z444 233 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 OR4S2Q8NH73 311 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 MS4A10Q96PG2 267 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 FZR1Q9UM11 496 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 CACNA1DQ01668 2161 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 MED13Q9UHV7 2174 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa7.19□□□□□ -1.26
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PKP4-210ENST00000480171 EREGO14944 169 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 GFRA3O60609 400 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 CECR9P0C854 216 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 TIMP3P35625 211 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 RELBQ01201 579 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 TEPPQ6URK8 271 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 ZNF114Q8NC26 417 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 NAGKQ9UJ70 344 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 TCF19Q9Y242 345 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 GTF3C1Q12789 2109 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 LNP1A1A4G5 178 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-210ENST00000480171 IGHG3P01860 377 aa7.19□□□□□ -1.26
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