RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 S1PR2O95136 353 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-209ENST00000473406 SOD1P00441 154 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-209ENST00000473406 RBP1P09455 135 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-209ENST00000473406 SULT1A3P0DMM9 295 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-209ENST00000473406 SULT1A4P0DMN0 295 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-209ENST00000473406 ERP29P30040 261 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-209ENST00000473406 CSN1S1P47710 185 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-209ENST00000473406 RBM11P57052 281 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
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RABGGTB-209ENST00000473406 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP3.47□□□□□ -1.85
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RABGGTB-209ENST00000473406 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-209ENST00000473406 RASSF5Q8WWW0 418 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-209ENST00000473406 C20orf27Q9GZN8 174 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-209ENST00000473406 EFCAB1Q9HAE3 211 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-209ENST00000473406 R4GN34 69 aa3.47□□□□□ -1.85
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RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 C17orf98A8MV24 154 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP5D1E7EU14 171 aa3.46□□□□□ -1.86
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RABGGTB-209ENST00000473406 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 CPMP14384 443 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 TSNQ15631 228 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF141Q15928 474 aa3.46□□□□□ -1.86
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RABGGTB-209ENST00000473406 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR119Q8TDV5 335 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 HEY1Q9Y5J3 304 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 DPRXA6NFQ7 191 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 IFNA21P01568 189 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 PPIBP23284 216 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 SERPINB1P30740 379 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 CD200P41217 278 aa3.45□□□□□ -1.86
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RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF117Q03924 483 aa3.45□□□□□ -1.86
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RABGGTB-209ENST00000473406 TOMM6Q96B49 74 aa3.45□□□□□ -1.86
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RABGGTB-209ENST00000473406 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 PRNDQ9UKY0 176 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 COL18A1P39060 1754 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 PRR14LQ5THK1 2151 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 NISCHQ9Y2I1 1504 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 SMIM17P0DL12 118 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 IFI30P13284 250 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
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RABGGTB-209ENST00000473406 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 CLDND2Q8NHS1 167 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC7A6Q92536 515 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 DDA1Q9BW61 102 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 TTTY13Q9BZ97 58 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 CYTL1Q9NRR1 136 aa3.44□□□□□ -1.86
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RABGGTB-209ENST00000473406 CYSLTR1Q9Y271 337 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 DOCK6Q96HP0 2047 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 G3V2T6 193 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 TP53I11O14683 189 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV3-11P04433 115 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 PRM2P04554 102 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 IDO1P14902 403 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 RWDD2BP57060 319 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 GRINAQ7Z429 371 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A40Q8TBP6 338 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR146Q96CH1 333 aa3.43□□□□□ -1.86
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RABGGTB-209ENST00000473406 IL36BQ9NZH7 164 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGEF11O15085 1522 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 NUP160Q12769 1436 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 TXNDC9O14530 226 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 SYNGR2O43760 224 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 NPYP01303 97 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 CBR1P16152 277 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST1H2BOP23527 126 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST1H2BBP33778 126 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 PHBP35232 272 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST1H2BDP58876 126 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 NCALDP61601 193 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST1H2BCP62807 126 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 GNG5P63218 68 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 AKR1C1Q04828 323 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
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