RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443238.5

CHN1-208, Transcript of chimerin 1, human

TSL 4

Gene CHN1, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHN1-208	ENST00000443238	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	TNFSF12	O43508	249 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	SCGN	O76038	276 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	GABARAP	O95166	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	CA2	P00918	260 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	HLA-DRB1	P01911	266 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	OPN1MW	P04001	364 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	APELA	P0DMC3	54 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	IGLL1	P15814	213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	ELK1	P19419	428 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	VDAC1	P21796	283 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	AADAC	P22760	399 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	FXYD4	P59646	89 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	GNB1	P62873	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	SLC35B1	P78383	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	DEFA5	Q01523	94 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	SPCS2	Q15005	226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	PSG5	Q15238	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	CTF1	Q16619	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238		Q6ZS49	121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	KCTD9	Q7L273	389 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	NPB	Q8NG41	125 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	OR5B12	Q96R08	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	OR51J1	Q9H342	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	IFT46	Q9NQC8	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	DIABLO	Q9NR28	239 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238		A0A1W2PN81	502 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	FAM25A	B3EWG3	89 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	FAM25C	B3EWG5	89 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	FAM25G	B3EWG6	89 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	XRCC3	O43542	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	SOX15	O60248	233 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	CRYZL1	O95825	349 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	FCGR2C	P31995	323 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	MC5R	P33032	325 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	CHRNA7	P36544	502 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	ALDH3B2	P48448	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	RAB25	P57735	213 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	CX3CL1	P78423	397 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	PITPNA	Q00169	270 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	CNIH2	Q6PI25	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	TMEM17	Q86X19	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	RNF183	Q96D59	192 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	OR4F4	Q96R69	305 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHN1-208	ENST00000443238	TG	P01266	2768 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHN1-208	ENST00000443238		A0A0A6YYH2	397 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHN1-208	ENST00000443238		A6NJ64	397 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHN1-208	ENST00000443238	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CHN1-208	ENST00000443238	FCGR3B	O75015	233 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHN1-208	ENST00000443238	RBBP9	O75884	186 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHN1-208	ENST00000443238	DIRAS3	O95661	229 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHN1-208	ENST00000443238	PPY	P01298	95 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHN1-208	ENST00000443238	IGHG4	P01861	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHN1-208	ENST00000443238	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHN1-208	ENST00000443238	PMP2	P02689	132 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHN1-208	ENST00000443238	IGF1	P05019	195 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHN1-208	ENST00000443238	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CHN1-208	ENST00000443238	OR5H8	P0DN80	308 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHN1-208	ENST00000443238	PSMB8	P28062	276 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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