RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 Q6AWC8 147 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 VWDEQ8N2E2 1590 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 LINC00477Q96M19 166 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 MYO9BQ13459 2157 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 LINC01553A4QN01 128 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 DAD1P61803 113 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 NMSQ5H8A3 153 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 FAM182BQ5T319 152 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM78Q5T7P6 136 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 MARCH3Q86UD3 253 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 FAM174AQ8TBP5 190 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 SHPRHQ149N8 1683 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 CGB1A6NKQ9 187 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 HMGN4O00479 90 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 WDR38Q5JTN6 314 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM54Q969K7 222 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 CHCHD5Q9BSY4 110 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 HCSTQ9UBK5 93 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 PRR36Q9H6K5 1346 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 USP32Q8NFA0 1604 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PPC4 97 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM89A2RUT3 159 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 ZFAND5O76080 213 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 PRSS2P07478 247 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 SCTP09683 121 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 PFN2P35080 140 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 GZMMP51124 257 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF718Q3SXZ3 478 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 FAM219BQ5XKK7 198 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 CEND1Q8N111 149 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 SHISA5Q8N114 240 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 FGF14Q92915 247 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 PBOV1Q9GZY1 135 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 DSPPQ9NZW4 1301 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 WIPF1O43516 503 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A20O43772 301 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 PDCD6O75340 191 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 GATA3P23771 443 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA0040Q15053 153 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 CENPWQ5EE01 88 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 C1orf140Q5VVS0 124 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 STHQ8IWL8 128 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 MKXQ8IYA7 352 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 FAM57AQ8TBR7 257 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 BCL2L10Q9HD36 194 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 RARRES3Q9UL19 164 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 PDPNQ86YL7 162 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 KIR2DL4Q99706 377 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 RAXQ9Y2V3 346 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 R4GMQ9 66 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 UPK2O00526 184 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 EDN2P20800 178 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 CKS2P33552 79 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 CST6Q15828 149 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 PIANPQ8IYJ0 282 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 GCSAMQ8N6F7 178 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 SPTSSAQ969W0 71 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 DDIT4LQ96D03 193 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 PYGO2Q9BRQ0 406 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 TNS2Q63HR2 1409 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 COX7A2P2O60397 106 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 CRLF1O75462 422 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 AGFG2O95081 481 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 COX6A1P12074 109 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 PGLYRP4Q96LB8 373 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 C1RLQ9NZP8 487 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 RHODO00212 210 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 FFAR1O14842 300 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 CECR9P0C854 216 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 RBMY1CP0DJD4 496 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 CD40P25942 277 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 RPS27P42677 84 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 C8orf46Q8TAG6 207 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 SSC4DQ8WTU2 575 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 SHISA9B4DS77 424 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 K7ERJ3 54 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 MSCO60682 206 aa4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms