RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 M0QZ24 198 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM90A15PP0C7V4 464 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM90A13PP0C7W8 464 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM90A14PP0C7W9 464 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM90A24PP0C7X0 464 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 SAP30LQ9HAJ7 183 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1B0GU03 582 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 DVL1O14640 695 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 LY6HO94772 140 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 CCL3L1P16619 93 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 MZT1Q08AG7 82 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 GFI1BQ5VTD9 330 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 GATAD1Q8WUU5 269 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 EDARADDQ8WWZ3 215 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 C5orf52A6NGY3 159 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 LINC00473A8K010 186 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM238C9JI98 176 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 PITX3O75364 302 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 KCNIP4Q6PIL6 250 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 OR10G4Q8NGN3 311 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 OR10G9Q8NGN4 311 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 OR10G7Q8NGN6 311 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 SMIM8Q96KF7 97 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 UBE2CO00762 179 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 SPINK4O60575 86 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 IGKV1-39P01597 117 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 IGKV1D-39P04432 117 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 DLK1P80370 383 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR73Q6P4I2 378 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 BTNL8Q6UX41 500 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 C22orf34Q6ZV56 151 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 OR10A7Q8NGE5 316 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF7Q9UBF6 113 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 TRAV3A0A0B4J244 114 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 TNFSF13O75888 250 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 LINC00614P0C842 121 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 MSMPQ1L6U9 139 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM56Q96MV1 263 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 PDE6DO43924 150 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 IFNA1P01562 189 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 ASCL5Q7RTU5 278 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF645Q8N7E2 425 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 PLSCR2Q9NRY7 297 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF737O75373 536 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 CHRNA7P36544 502 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 BSPH1Q075Z2 132 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 UTF1Q5T230 341 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 OR10W1Q8NGF6 305 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 CALYQ9NYX4 217 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 PCSK5Q92824 1860 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 COL12A1Q99715 3063 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 ZZEF1O43149 2961 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRC30A6NM36 301 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 BMPR1BO00238 502 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 TCF15Q12870 199 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 NMSQ5H8A3 153 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC24A4Q8NFF2 622 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 PAGE4O60829 102 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 HBE1P02100 147 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 OR10J1P30954 320 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 TAS2R30P59541 319 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 STUMQ69YW2 141 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 K7EQM0 130 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 CEACAM1P13688 526 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF585BQ52M93 769 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 ANKRD39Q53RE8 183 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 RPL31P62899 125 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 ID3Q02535 119 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 IL15RAQ13261 267 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 PIP4P1Q86T03 277 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 OR8I2Q8N0Y5 310 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 GCSAMQ8N6F7 178 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 PRSS33Q8NF86 280 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 TNFRSF14Q92956 283 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 SERTAD4Q9NUC0 356 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 PITPNC1Q9UKF7 332 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 CENPEQ02224 2701 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 GAGE10A6NGK3 116 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 A8MXE2 369 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 CD40P25942 277 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 CD81P60033 236 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 IGFBPL1Q8WX77 278 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 DKK4Q9UBT3 224 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 REG1AP05451 166 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 STAG3L2P0CL84 134 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 PSMB3P49720 205 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms