RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSMB6P28072 239 aa13.48□□□□□ -0.25
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa13.48□□□□□ -0.25
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TOP3BP1-201ENST00000420768 Q71RC1 249 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 C5orf56Q8N8D9 126 aa13.48□□□□□ -0.25
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TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM157CP0CG43 387 aa13.45□□□□□ -0.26
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CLDN34H7C241 214 aa13.45□□□□□ -0.26
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB40CQ96S21 281 aa13.45□□□□□ -0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAGT1Q9H0U3 335 aa13.45□□□□□ -0.26
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CEBPZOSA8MTT3 80 aa13.44□□□□□ -0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHRNA7P36544 502 aa13.44□□□□□ -0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 FXYD3Q14802 87 aa13.44□□□□□ -0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 C11orf87Q6NUJ2 197 aa13.44□□□□□ -0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRSS54Q6PEW0 395 aa13.44□□□□□ -0.26
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TOP3BP1-201ENST00000420768 JMJD8Q96S16 334 aa13.44□□□□□ -0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLEKHA3Q9HB20 300 aa13.44□□□□□ -0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 ENY2Q9NPA8 101 aa13.44□□□□□ -0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNFRSF19Q9NS68 423 aa13.44□□□□□ -0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa13.43□□□□□ -0.26
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TOP3BP1-201ENST00000420768 INS-IGF2F8WCM5 200 aa13.43□□□□□ -0.26
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TOP3BP1-201ENST00000420768 OPN1MW3P0DN78 364 aa13.43□□□□□ -0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC25A4P12235 298 aa13.43□□□□□ -0.26
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TAS2R30P59541 319 aa13.43□□□□□ -0.26
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TOP3BP1-201ENST00000420768 C10orf55Q5SWW7 151 aa13.43□□□□□ -0.26
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TOP3BP1-201ENST00000420768 HINT2Q9BX68 163 aa13.43□□□□□ -0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 HIPK2Q9H2X6 1198 aa13.43□□□□□ -0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSPG4Q6UVK1 2322 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 E5RGE8 158 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 G3V3Q6 166 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 H0YIZ8 118 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 L7N2F9 121 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 HILS1P60008 231 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 VAMP2P63027 116 aa13.42□□□□□ -0.26
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