RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380340.8

APH1B-202, Transcript of aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit, humanhuman

TSL 2

Gene APH1B, Length 872 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1B-202ENST00000380340 ZNF503Q96F45 646 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 C5orf30Q96GV9 206 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 ATG101Q9BSB4 218 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 LINC00473A8K010 186 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 TRDCB7Z8K6 153 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 CYB5BO43169 146 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 KBTBD11O94819 623 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 REG1AP05451 166 aa7.3□□□□□ -1.24
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APH1B-202ENST00000380340 Q499Y3 187 aa7.3□□□□□ -1.24
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APH1B-202ENST00000380340 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.3□□□□□ -1.24
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APH1B-202ENST00000380340 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 AK3Q9UIJ7 227 aa7.3□□□□□ -1.24
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APH1B-202ENST00000380340 ATP6AP1Q15904 470 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 XAF1Q6GPH4 301 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 AMIGO2Q86SJ2 522 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.29□□□□□ -1.24
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APH1B-202ENST00000380340 OR4A4PQ8NGN8 299 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 SMIM19Q96E16 107 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 SLC29A1Q99808 456 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 TMEM59Q9BXS4 323 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 NACAE9PAV3 2078 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 A0A1W2PPK0 400 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 FAM229AH3BQW9 127 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 BET1O15155 118 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 OGG1O15527 345 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 FCGR3BO75015 233 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 SSX1Q16384 188 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 YIF1BQ5BJH7 314 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 OR10K2Q6IF99 312 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 TCF24Q7RTU0 167 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 GGHQ92820 318 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 TM2D1Q9BX74 207 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 MDFICQ9P1T7 246 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-202ENST00000380340 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.27□□□□□ -1.25
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APH1B-202ENST00000380340 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 TMEM189A5PLL7 270 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 FABP7O15540 132 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 CD3GP09693 182 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 LIMS3P0CW19 117 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 LIMS4P0CW20 117 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 HTN3P15516 51 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 CELP19835 753 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 CRHBPP24387 322 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 RPL8P62917 257 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 DUSP18Q8NEJ0 188 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 OR52I1Q8NGK6 324 aa7.27□□□□□ -1.25
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APH1B-202ENST00000380340 BABAM2Q9NXR7 383 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 AP4S1Q9Y587 144 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7.26□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 YIF1AO95070 293 aa7.26□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 DIRAS3O95661 229 aa7.26□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 HLA-GP17693 338 aa7.26□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 EMP1P54849 157 aa7.26□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 IGSF11Q5DX21 431 aa7.26□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 C1orf146Q5VVC0 180 aa7.26□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 TTC23Q5W5X9 447 aa7.26□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 ZNF414Q96IQ9 312 aa7.26□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 OR10C1Q96KK4 312 aa7.26□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 Q96MT0 163 aa7.26□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 C17orf77Q96MU5 243 aa7.26□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.26□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.26□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 AMBNQ9NP70 447 aa7.26□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.26□□□□□ -1.25
APH1B-202ENST00000380340 HSF4Q9ULV5 492 aa7.26□□□□□ -1.25
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