RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAB40CQ96S21 281 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 CYTL1Q9NRR1 136 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 MOSP00540 346 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD99P14209 185 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 PAX9P55771 341 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNFRSF9Q07011 255 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLEC9AQ6UXN8 241 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 HSPB7Q9UBY9 170 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 LY6G6DO95868 133 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 DEFB112Q30KQ8 113 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR2T10Q8NGZ9 312 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRAV3A0A0B4J244 114 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 TAAR5O14804 337 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 LGALS7P47929 136 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBE2KP61086 200 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 SSX3Q99909 188 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 AIFM2Q9BRQ8 373 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBXL17Q9UF56 701 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 TLN2Q9Y4G6 2542 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGSF23A1L1A6 192 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM106CPP0CH98 169 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 IAPPP10997 89 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 HTR2BP41595 481 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 F2RL1P55085 397 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 EBI3Q14213 229 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALKAL2Q6UX46 152 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 C9orf139Q6ZV77 190 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC25A31Q9H0C2 315 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 RBKSQ9H477 322 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 MED6O75586 246 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 NHLH2Q02577 135 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 TEX29Q8N6K0 151 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM252Q8N6L7 170 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR4A16Q8NH70 328 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNF5Q99942 180 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMIM3Q9BZL3 60 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 WSB1Q9Y6I7 421 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC25A17O43808 307 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 DYNLT3P51808 116 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR2B8PP59922 312 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 THNSL2Q86YJ6 484 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 STOML3Q8TAV4 291 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 PIFOQ8TCI5 191 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM11P17152 192 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 RELBQ01201 579 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 PSG5Q15238 335 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 Q8N6K4 173 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 BET1LQ9NYM9 111 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 TPT1P13693 172 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 MMDQ15546 238 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 VMA21Q3ZAQ7 101 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMIM8Q96KF7 97 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 PSENENQ9NZ42 101 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 H3BP45 60 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 SRP14P37108 136 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 AARDQ4LEZ3 155 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 SCARB1Q8WTV0 552 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 TPSG1Q9NRR2 321 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 KBTBD11O94819 623 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 FOSL1P15407 271 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 TAS2R30P59541 319 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 H3BUX3 64 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 UPK2O00526 184 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 NDUFA5Q16718 116 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 BAP18Q8IXM2 172 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 VSTM2AQ8TAG5 236 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBXL15Q9H469 300 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 NBR2O15453 112 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 CRYGBP07316 175 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 NPBQ8NG41 125 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 PHYHIPLQ96FC7 376 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 CST7O76096 145 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 IFNA17P01571 189 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 BAXQ07812 192 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 TEX45Q8NA69 505 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 DTD1Q8TEA8 209 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZDHHC16Q969W1 377 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 WFDC1Q9HC57 220 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 CEBPZOSA8MTT3 80 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 RRHO14718 337 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 HNF1AP20823 631 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 PJVKQ0ZLH3 352 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPINK9Q5DT21 86 aa22.11■■□□□ 1.13
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