RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 Q8N6K4 173 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 TEX45Q8NA69 505 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 DTD1Q8TEA8 209 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 KIAA1456Q9P272 454 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 SIGLEC9Q9Y336 463 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 TSC22D2O75157 780 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 SPCS3P61009 180 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 TNXAQ16473 311 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 PRSS8Q16651 343 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 AARDQ4LEZ3 155 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 TMEM219Q86XT9 240 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 OR4A5Q8NH83 315 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 SSX3Q99909 188 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 RNF5Q99942 180 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 FCN1O00602 326 aa14.19□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 CD5LO43866 347 aa14.19□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 MED6O75586 246 aa14.19□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 HKR1P10072 659 aa14.19□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 EBI3Q14213 229 aa14.19□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 LY6EQ16553 131 aa14.19□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa14.19□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.19□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 ZNF429Q86V71 674 aa14.19□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 SMR3AQ99954 134 aa14.19□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 COMMD5Q9GZQ3 224 aa14.19□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 MEGF9Q9H1U4 602 aa14.19□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 PSENENQ9NZ42 101 aa14.19□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 ZANQ9Y493 2812 aa14.19□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 IGSF23A1L1A6 192 aa14.18□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 H3BUX3 64 aa14.18□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 SPDEFO95238 335 aa14.18□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 RPL12P30050 165 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 PPP1R27Q86WC6 154 aa14.18□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 PIFOQ8TCI5 191 aa14.18□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 RAB40CQ96S21 281 aa14.18□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 ABCA1O95477 2261 aa14.18□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 NDUFA3O95167 84 aa14.18□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 FGF2P09038 288 aa14.18□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 P2RY1P47900 373 aa14.18□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 SPANXN5Q5MJ07 72 aa14.18□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa14.18□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 TMUB2Q71RG4 321 aa14.18□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 OR2C3Q8N628 320 aa14.18□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 NPBQ8NG41 125 aa14.18□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 OR52E5Q8NH55 327 aa14.18□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 ARL6Q9H0F7 186 aa14.18□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 E7EUB6 86 aa14.17□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 CA2P00918 260 aa14.17□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 C5orf64Q2M2E5 130 aa14.17□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 THNSL2Q86YJ6 484 aa14.17□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 MMD2Q8IY49 270 aa14.17□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 OR10W1Q8NGF6 305 aa14.17□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 AQP10Q96PS8 301 aa14.17□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 OR4C12Q96R67 309 aa14.17□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 SMIM3Q9BZL3 60 aa14.17□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 GPR137BO60478 399 aa14.16□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 ACTL6BO94805 426 aa14.16□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 APELAP0DMC3 54 aa14.16□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 SMIM8Q96KF7 97 aa14.16□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 PLEKHA3Q9HB20 300 aa14.16□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 ENY2Q9NPA8 101 aa14.16□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 TNFRSF19Q9NS68 423 aa14.16□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 FKBP11Q9NYL4 201 aa14.16□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa14.16□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 NOTCH2Q04721 2471 aa14.16□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 A0A1B0GW64 132 aa14.15□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 CGB1A6NKQ9 187 aa14.15□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 CST7O76096 145 aa14.15□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 DYNLT3P51808 116 aa14.15□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 BPIFB3P59826 476 aa14.15□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 PRCDQ00LT1 54 aa14.15□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP14.15□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 OR2F1Q13607 317 aa14.15□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 KCNRGQ8N5I3 272 aa14.15□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 OR1L8Q8NGR8 309 aa14.15□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 OR5B3Q8NH48 314 aa14.15□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.15□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 MYO9AB2RTY4 2548 aa14.15□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 METTL15P1P0C7V9 234 aa14.15□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 SRP14P37108 136 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 NHLH2Q02577 135 aa14.15□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 OPCMLQ14982 345 aa14.15□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 TMEM252Q8N6L7 170 aa14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms