RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361490.8

HPS1-204, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 3,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-204ENST00000361490 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 SLC24A4Q8NFF2 622 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 Q8TCH9 128 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 CCL19Q99731 98 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 TANC2Q9HCD6 1990 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 FGF2P09038 288 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 CD1BP29016 333 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 SPCS3P61009 180 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 RPL8P62917 257 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 MIC13Q5XKP0 118 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 ATRAIDQ6UW56 229 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 SVBPQ8N300 66 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 TMEM147Q9BVK8 224 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 RPH3ALQ9UNE2 315 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 TMEM218A2RU14 115 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 CA2P00918 260 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 PPOXP50336 477 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 TAS2R30P59541 319 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 TEX36Q5VZQ5 186 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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HPS1-204ENST00000361490 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 HTR1DP28221 377 aa9.5□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 KIR2DS2P43631 304 aa9.5□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa9.5□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 OR4C13Q8NGP0 309 aa9.5□□□□□ -0.89
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HPS1-204ENST00000361490 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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HPS1-204ENST00000361490 WASHC3Q9Y3C0 194 aa9.5□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa9.5□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 OR7C2O60412 319 aa9.5□□□□□ -0.89
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HPS1-204ENST00000361490 BRWD1-AS2P59051 145 aa9.5□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 C19orf35Q6ZS72 473 aa9.5□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 TCF23Q7RTU1 214 aa9.5□□□□□ -0.89
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HPS1-204ENST00000361490 C22orf46C9J442 243 aa9.49□□□□□ -0.89
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HPS1-204ENST00000361490 HSPB7Q9UBY9 170 aa9.49□□□□□ -0.89
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HPS1-204ENST00000361490 CLEC2AQ6UVW9 174 aa9.48□□□□□ -0.89
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HPS1-204ENST00000361490 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
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HPS1-204ENST00000361490 IGKV1-33P01594 117 aa9.48□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 ORM2P19652 201 aa9.48□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 TPSG1Q9NRR2 321 aa9.48□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 AUP1Q9Y679 476 aa9.48□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 CHD6Q8TD26 2715 aa9.48□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 IFNA1P01562 189 aa9.47□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 HBE1P02100 147 aa9.47□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 COX6B1P14854 86 aa9.47□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 RAB5CP51148 216 aa9.47□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 PARP11Q9NR21 331 aa9.47□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 MLXQ9UH92 298 aa9.47□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
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