RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 CACFD1Q9UGQ2 172 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM127O75204 238 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 GGCTO75223 188 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 UPK1BO75841 260 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 AVPP01185 164 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CD3DP04234 171 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ELANEP08246 267 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 GP9P14770 177 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 MORN2Q502X0 79 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 FAM74A1Q5RGS3 127 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf100Q5SVJ3 147 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 LCN12Q6JVE5 192 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB34Q8NCN2 500 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR1B1Q8NGR6 318 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 MDFIQ99750 246 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC32Q9BV29 185 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 WNT10AQ9GZT5 417 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ARL6Q9H0F7 186 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RNF24Q9Y225 148 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ITPR2Q14571 2701 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV24A0A0B4J272 114 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SOX15O60248 233 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR7C2O60412 319 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 IL7P13232 177 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 GALR1P47211 349 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 STPG2Q8N412 459 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SEC22AQ96IW7 307 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 UFC1Q9Y3C8 167 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR11H12B2RN74 326 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 BMPR1BO00238 502 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 XRCC3O43542 346 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 FCGR3AP08637 254 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 H2AFB2P0C5Z0 115 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 IER3P46695 156 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 CD81P60033 236 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF146Q15072 292 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 BAK1Q16611 211 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 C15orf32Q32M92 178 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 AKIRIN2Q53H80 203 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PRR31Q5SQ13 230 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TEX36Q5VZQ5 186 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZFAND6Q6FIF0 208 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ABHD1Q96SE0 405 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 AAMDCQ9H7C9 122 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 OR2T8A6NH00 312 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 K7EQM0 130 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ATP6V0E1O15342 81 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV3-1P01715 115 aa3.58□□□□□ -1.84
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PTPRC-201ENST00000348564 SCAND1P57086 179 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM177Q53S58 311 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 Q6YL49 198 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TERB2Q8NHR7 220 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 NDFIP1Q9BT67 221 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TPPP3Q9BW30 176 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SRRQ9GZT4 340 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 LPAR5Q9H1C0 372 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM140Q9NV12 185 aa3.58□□□□□ -1.84
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PTPRC-201ENST00000348564 V9GYH0 126 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZFHX4Q86UP3 3567 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 JTBO76095 146 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 CHATP28329 748 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 RND2P52198 227 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 DHODHQ02127 395 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 FAAP20Q6NZ36 180 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF66Q6ZN08 573 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 FAM219AQ8IW50 185 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 CDH26Q8IXH8 852 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 Q96M66 194 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A31Q9H0C2 315 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ATMQ13315 3056 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 YPEL1O60688 119 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV1D-12P01611 117 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 RD3LP0DJH9 198 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 RAB6AP20340 208 aa3.58□□□□□ -1.84
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