RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339007.3

LRRC25-201, Transcript of leucine rich repeat containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC25, Length 2,415 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25-201ENST00000339007 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 RELBQ01201 579 aa15.17■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 OR5I1Q13606 314 aa15.17■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 RAB31Q13636 194 aa15.17■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 SMIM21Q3B7S5 101 aa15.17■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 WDR73Q6P4I2 378 aa15.17■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 DCTN5Q9BTE1 182 aa15.17■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 FAM234AQ9H0X4 552 aa15.17■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 CXXC4Q9H2H0 198 aa15.17■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 DIRC3C9JPN6 131 aa15.17■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 M0R1X1 148 aa15.17■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 SP1P08047 785 aa15.17■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 AREGP15514 252 aa15.17■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 GNG4P50150 75 aa15.17■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 MEOX1P50221 254 aa15.17■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 MSL2Q9HCI7 577 aa15.17■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 GNG12Q9UBI6 72 aa15.17■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 NAT8BQ9UHF3 227 aa15.17■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 FOXH1O75593 365 aa15.16■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 OR4P4Q8NGL7 312 aa15.16■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 PLPPR2Q96GM1 343 aa15.16■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 TMEM140Q9NV12 185 aa15.16■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 TCF19Q9Y242 345 aa15.16■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 CBY1Q9Y3M2 126 aa15.16■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 RNF114Q9Y508 228 aa15.16■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 TRAV3A0A0B4J244 114 aa15.16■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa15.16■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 OR10J4P0C629 311 aa15.16■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 OR10J3Q5JRS4 329 aa15.16■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 ZPBPQ9BS86 351 aa15.16■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 CGAP01215 116 aa15.15■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 CX3CL1P78423 397 aa15.15■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 EDDM3AQ14507 147 aa15.15■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 CENPWQ5EE01 88 aa15.15■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 C1orf174Q8IYL3 243 aa15.15■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 GCNT2Q8N0V5 402 aa15.15■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 Q8N976 141 aa15.15■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa15.15■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 HELTA6NFD8 242 aa15.15■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 AMTP48728 403 aa15.15■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 COX19Q49B96 90 aa15.15■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 KCNS1Q96KK3 526 aa15.15■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 S1PR3Q99500 378 aa15.15■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 NRN1Q9NPD7 142 aa15.15■□□□□ 0.02
LRRC25-201ENST00000339007 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa15.14■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 MORN2Q502X0 79 aa15.14■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 JPT1Q9UK76 154 aa15.14■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 ZFP30Q9Y2G7 519 aa15.14■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 NPY1RP25929 384 aa15.14■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 CTRLP40313 264 aa15.14■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 SPATA45Q537H7 98 aa15.14■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 RPL39P5Q59GN2 51 aa15.14■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 FAM216AQ8WUB2 273 aa15.14■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 SLC45A2Q9UMX9 530 aa15.14■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa15.13■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 SPINK4O60575 86 aa15.13■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF253O75346 499 aa15.13■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 LYZL6O75951 148 aa15.13■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 IGHV1-2P23083 117 aa15.13■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 RAB7AP51149 207 aa15.13■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 TMEM136Q6ZRR5 245 aa15.13■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 SLC24A4Q8NFF2 622 aa15.13■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 DEFB127Q9H1M4 99 aa15.13■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 OR5G3P0C626 314 aa15.13■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 TFPI2P48307 235 aa15.13■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 PQLC2Q6ZP29 291 aa15.13■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 DOLPP1Q86YN1 238 aa15.13■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 SLC35E1Q96K37 410 aa15.13■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 OSTCQ9NRP0 149 aa15.13■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 TMEM167BQ9NRX6 74 aa15.13■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 UQCR10Q9UDW1 63 aa15.13■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 IL19Q9UHD0 177 aa15.13■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa15.12■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 DMDP11532 3685 aa15.12■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 A0A1W2PS18 150 aa15.12■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 C15orf61A6NNL5 157 aa15.12■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 MMP23AO75900 390 aa15.12■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 COL8A2P25067 703 aa15.12■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 CRYBB3P26998 211 aa15.12■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 KIR2DS2P43631 304 aa15.12■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 PRR20EP86478 221 aa15.12■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 PRR20CP86479 221 aa15.12■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 PRR20DP86480 221 aa15.12■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 PRR20BP86481 221 aa15.12■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 PRR20AP86496 221 aa15.12■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 PSG5Q15238 335 aa15.12■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 TIGITQ495A1 244 aa15.12■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
LRRC25-201ENST00000339007 DMRTA1Q5VZB9 504 aa15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms