RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 POMT1Q9Y6A1 747 aa21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 MED6O75586 246 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 FGF2P09038 288 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAS1LP35410 378 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 ID3Q02535 119 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNFRSF9Q07011 255 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPCS3P61009 180 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 GNB1P62873 340 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD300CQ08708 224 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNXAQ16473 311 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 C16orf82Q7Z2V1 217 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 THAP6Q8TBB0 222 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAGT1Q9H0U3 335 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNFRSF19Q9NS68 423 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSPB7Q9UBY9 170 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMLR1H3BR10 107 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 MPC2O95563 127 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 PJVKQ0ZLH3 352 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 AARDQ4LEZ3 155 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q8N9W7 124 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR1L8Q8NGR8 309 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5B3Q8NH48 314 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR52E5Q8NH55 327 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 HINT2Q9BX68 163 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEBPZOSA8MTT3 80 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 K7EPK0 472 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNIH1O95406 144 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 NAV3Q8IVL0 2385 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 M0QZK8 103 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 FGF16O43320 207 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 SYNGR2O43760 224 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 SSSCA1O60232 199 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 CA2P00918 260 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 OPN1MWP04001 364 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 OPN1MW2P0DN77 364 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 OPN1MW3P0DN78 364 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 ENY2Q9NPA8 101 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 VPREB3Q9UKI3 123 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 L7N2F9 121 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 FCN1O00602 326 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 VAMP2P63027 116 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZFP69Q49AA0 526 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBKSQ9H477 322 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 INAFM1C9JVW0 142 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYOD1P15172 320 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q5BKY6 102 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 C11orf87Q6NUJ2 197 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 C5orf56Q8N8D9 126 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 HIVEP2P31629 2446 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHST1O43916 411 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 DEDDO75618 318 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPINK9Q5DT21 86 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRSS54Q6PEW0 395 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM86BQ8N661 226 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB40CQ96S21 281 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1QBP02746 253 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 COMPP49747 757 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 DTD1Q8TEA8 209 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLEKHA3Q9HB20 300 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 MBD2Q9UBB5 411 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 SONP18583 2426 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FXYD3Q14802 87 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 TUSC1Q2TAM9 212 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF562Q6V9R5 426 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 HIPK2Q9H2X6 1198 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 E5RGE8 158 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 LY86O95711 162 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 IAPPP10997 89 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 C10orf55Q5SWW7 151 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABHD5Q8WTS1 349 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 DCUN1D4Q92564 292 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5AC2Q9NZP5 309 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PN81 502 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR137BO60478 399 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHRNA7P36544 502 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
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