RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 LHX4Q969G2 390 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 ARV1Q9H2C2 271 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM14BQ9NUH8 114 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 C15orf61A6NNL5 157 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 ODF3BA8MYP8 253 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 JTBO76095 146 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 APOA2P02652 100 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 S100A6P06703 90 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 MYOD1P15172 320 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 IL3RAP26951 378 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 DYNLT3P51808 116 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 PDPNQ86YL7 162 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4A16Q8NH70 328 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 DTD1Q8TEA8 209 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 TMED6Q8WW62 240 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 ZFHX3Q15911 3703 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 PLXNB1O43157 2135 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 IGLV2-23P01705 113 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 SULT1A1P50225 295 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 BAXQ07812 192 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 SPANXN5Q5MJ07 72 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF787Q6DD87 383 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 OR52E5Q8NH55 327 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 HARBI1Q96MB7 349 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4C12Q96R67 309 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 KPTNQ9Y664 436 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 NDUFS8O00217 210 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 MED6O75586 246 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 ARG1P05089 322 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PPI3 338 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 IFNA17P01571 189 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM157CP0CG43 387 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 SPCS3P61009 180 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 CLEC2AQ6UVW9 174 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 PFDN5Q99471 154 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 BET1LQ9NYM9 111 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 UPK2O00526 184 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 CRYBA1P05813 215 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 PAX6P26367 422 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 MC5RP33032 325 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 CEBPZOSA8MTT3 80 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 J3QKU1 62 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 STX12Q86Y82 276 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 TBX15Q96SF7 602 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 GINS3Q9BRX5 216 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 TCF19Q9Y242 345 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 RFNGQ9Y644 331 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 NAV2Q8IVL1 2488 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1B0GV90 55 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PRD5 423 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PRF3 423 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PRM7 423 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXO24O75426 580 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 HTR1DP28221 377 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 RPEQ96AT9 228 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXH1O75593 365 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 KBTBD11O94819 623 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 FGF2P09038 288 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 TREM1Q9NP99 234 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 DPM3Q9P2X0 92 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 C15orf62A8K5M9 175 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 BLOC1S1P78537 153 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 MOB3BQ86TA1 216 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 OR1S2Q8NGQ3 325 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.2 ms