RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 OR8I2Q8N0Y5 310 aa18.33■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 ULBP2Q9BZM5 246 aa18.33■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa18.33■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa18.32■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 K7EP34 96 aa18.32■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 CRYAAP02489 173 aa18.32■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 CA7P43166 264 aa18.32■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa18.32■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 A0A0G2JRQ6 117 aa18.32■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 H0Y980 276 aa18.32■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 RAC3P60763 192 aa18.32■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 EBLN2Q6P2I7 272 aa18.32■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 TMEM136Q6ZRR5 245 aa18.32■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa18.32■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 MED13Q9UHV7 2174 aa18.32■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 RER1O15258 196 aa18.31■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 COX5AP20674 150 aa18.31■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 NPY1RP25929 384 aa18.31■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 SRIP30626 198 aa18.31■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 PLA2G5P39877 138 aa18.31■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 SPINK14Q6IE38 97 aa18.31■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa18.31■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 OCC1Q8TAD7 63 aa18.31■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 TP73-AS1Q9UF72 201 aa18.31■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 SHANK1Q9Y566 2161 aa18.31■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 ATP5G3P48201 142 aa18.31■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 PLP1P60201 277 aa18.31■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 SLAQ13239 276 aa18.31■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 MMD2Q8IY49 270 aa18.31■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 GAPTQ8N292 157 aa18.31■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 POM121L2Q96KW2 1035 aa18.31■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 SLC7A10Q9NS82 523 aa18.31■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 LRP5LA4QPB2 252 aa18.3■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 SLC17A3O00476 420 aa18.3■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 IAPPP10997 89 aa18.3■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 CYB561P49447 251 aa18.3■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 SLC38A11Q08AI6 406 aa18.3■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa18.3■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 PP6455Q8WZ26 134 aa18.3■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 TXNDC17Q9BRA2 123 aa18.3■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 REG1BP48304 166 aa18.3■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 TMEM249Q2WGJ8 235 aa18.3■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa18.3■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa18.3■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 BMPR1BO00238 502 aa18.29■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 CRYBB3P26998 211 aa18.29■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 SEC11AP67812 179 aa18.29■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 HSD52Q0P140 79 aa18.29■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 KIAA1644Q3SXP7 199 aa18.29■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 GGNQ86UU5 652 aa18.29■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa18.29■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 C2orf70A6NJV1 201 aa18.29■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 SSTR5P35346 364 aa18.29■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 ZNF479Q96JC4 524 aa18.29■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 NPIPA3F8WFD2 350 aa18.28■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 PSG7Q13046 419 aa18.28■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 PIGTQ969N2 578 aa18.28■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 C1RLQ9NZP8 487 aa18.28■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 C9orf118A6NHY6 69 aa18.28■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 IGLV3-1P01715 115 aa18.28■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 NTF4P34130 210 aa18.28■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 TMEM211Q6ICI0 200 aa18.28■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 TMEM54Q969K7 222 aa18.28■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 HES7Q9BYE0 225 aa18.28■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 SERPINE2P07093 398 aa18.27■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 CX3CL1P78423 397 aa18.27■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 PMP22Q01453 160 aa18.27■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 DTX1Q86Y01 620 aa18.27■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 OR5A1Q8NGJ0 315 aa18.27■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 OR2AE1Q8NHA4 323 aa18.27■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 C10orf35Q96D05 121 aa18.27■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 SCNM1Q9BWG6 230 aa18.27■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 THYN1Q9P016 225 aa18.27■□□□□ 0.52
PITX1-201ENST00000265340 C21orf140B9A014 251 aa18.27■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 NEURL1O76050 574 aa18.27■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 HLA-DQA1P01909 254 aa18.27■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 AP1S3Q96PC3 154 aa18.27■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 Q6ZPA2 131 aa18.26■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 RDH5Q92781 318 aa18.26■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 LYZL4Q96KX0 146 aa18.26■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 GPHA2Q96T91 129 aa18.26■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 OR4C46A6NHA9 309 aa18.25■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa18.25■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 GP6Q9HCN6 339 aa18.25■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 A0A1W2PR80 420 aa18.25■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 C5orf63A6NC05 138 aa18.25■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 HSBP1O75506 76 aa18.25■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 C10orf128Q5T292 105 aa18.25■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 MTURNQ8N3F0 131 aa18.25■□□□□ 0.51
PITX1-201ENST00000265340 NABP1Q96AH0 204 aa18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms