RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 CACNG8Q8WXS5 425 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 UBE2L6O14933 153 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 STAG3L2P0CL84 134 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 C19orf54Q5BKX5 351 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 CLDND2Q8NHS1 167 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 PGLYRP4Q96LB8 373 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 RARRES2Q99969 163 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 PARLQ9H300 379 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 CBLN4Q9NTU7 201 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 RNF224P0DH78 156 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 TCF24Q7RTU0 167 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 ZIC4Q8N9L1 334 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 TBX15Q96SF7 602 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 SEMA5BQ9P283 1151 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 MOSP00540 346 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 IGKV1D-33P01593 117 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 IGKV1-33P01594 117 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 YPEL1O60688 119 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 VENTXO95231 258 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 BTF3P20290 206 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 YPEL2Q96QA6 119 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 TRGC2P03986 189 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF506Q5JVG8 444 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 RAXQ9Y2V3 346 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 SPTBP11277 2137 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 OR1N2Q8NGR9 330 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 Q5BKY6 102 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF383Q8NA42 475 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 CBY3A6NI87 242 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 HAX1O00165 279 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 SMUG1Q53HV7 270 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 ABCA7Q8IZY2 2146 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 PPP1R27Q86WC6 154 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 SPACA3Q8IXA5 215 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRE-201ENST00000254667 ARPC1AQ92747 370 aa15.96■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 FBXL7Q9UJT9 491 aa15.96■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 PMCHL1Q16048 86 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 MIEN1Q9BRT3 115 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 RTN4RQ9BZR6 473 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 SPRR3Q9UBC9 169 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 PAM16Q9Y3D7 125 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 PROB1E7EW31 1015 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 CIDEAO60543 219 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 C21orf62Q9NYP8 219 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 C2orf83Q53S99 150 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 HSPB9Q9BQS6 159 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 RPRMQ9NS64 109 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 IL18BPO95998 194 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 MDKP21741 143 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 TIMP3P35625 211 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 CRXO43186 299 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 PF4P02776 101 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 WDR82Q6UXN9 313 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 OR1P1Q8NH06 330 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 SFRP2Q96HF1 295 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 PINLYPA6NC86 204 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 J3QRE1 110 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 RRHO14718 337 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 LYZL4Q96KX0 146 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 LEPROTL1O95214 131 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 FAM89BQ8N5H3 189 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF502Q8TBZ5 544 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 C7orf69Q9H7B7 122 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 NBEAP1P0C6P0 100 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 ZP1P60852 638 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 FAM159AQ6UWV7 190 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 ERVH48-1M5A8F1 160 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 MARVELD3Q96A59 401 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 A6NJY4 79 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 NUDT3O95989 172 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF497Q6ZNH5 498 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 GPR82Q96P67 336 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 CHD5Q8TDI0 1954 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 ASXL3Q9C0F0 2248 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 OR4C46A6NHA9 309 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 IGHV3-48P01763 117 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 NMUP48645 174 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 CENPWQ5EE01 88 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 SAMD13Q5VXD3 122 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRE-201ENST00000254667 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms