RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233330.6

RTKN-201, Transcript of rhotekin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RTKN, Length 2,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN-201ENST00000233330 CD81P60033 236 aa16.09■□□□□ 0.17
RTKN-201ENST00000233330 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
RTKN-201ENST00000233330 PRNDQ9UKY0 176 aa16.09■□□□□ 0.17
RTKN-201ENST00000233330 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa16.08■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 A0A1W2PR64 198 aa16.08■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 A0A1W2PRV1 198 aa16.08■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 UPK2O00526 184 aa16.08■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 RAB5AP20339 215 aa16.08■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 NPY1RP25929 384 aa16.08■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 LOXP28300 417 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 CHRNB4P30926 498 aa16.08■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 RAB5BP61020 215 aa16.08■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa16.08■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 RELNP78509 3460 aa16.08■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 TNCP24821 2201 aa16.08■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 ZNF727A8MUV8 499 aa16.07■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 CCL21O00585 134 aa16.07■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 SOX15O60248 233 aa16.07■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 GRNP28799 593 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 ENY2Q9NPA8 101 aa16.07■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa16.07■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 C1orf196B1AJZ1 125 aa16.07■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 SEC14L6B5MCN3 397 aa16.07■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 OPRK1P41145 380 aa16.07■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 PSMB3P49720 205 aa16.07■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 MGST2Q99735 147 aa16.07■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 MANBALQ9NQG1 85 aa16.07■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 BIN3Q9NQY0 253 aa16.07■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 NDUFA2O43678 99 aa16.06■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 GCSAMLQ5JQS6 135 aa16.06■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 GGTLC1Q9BX51 225 aa16.06■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 BET1LQ9NYM9 111 aa16.06■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 B4DEV8 164 aa16.06■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 CA2P00918 260 aa16.06■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 AGAP20933 346 aa16.06■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 DLX6P56179 175 aa16.06■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 PRCDQ00LT1 54 aa16.06■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 C8orf31Q8N9H6 132 aa16.06■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 OR5AN1Q8NGI8 311 aa16.06■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 ZNF596Q8TC21 504 aa16.06■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 C1orf159Q96HA4 380 aa16.06■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 HINT2Q9BX68 163 aa16.06■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 H0YJW9 148 aa16.05■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 J3QR06 171 aa16.05■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 SIAH2O43255 324 aa16.05■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 KBTBD11O94819 623 aa16.05■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 APOA2P02652 100 aa16.05■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 LINC00311Q8N616 119 aa16.05■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 GATAD1Q8WUU5 269 aa16.05■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 RAB1CQ92928 201 aa16.05■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 NPVFQ9HCQ7 196 aa16.05■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 SIRT7Q9NRC8 400 aa16.05■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 SPTBN4Q9H254 2564 aa16.05■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 YIF1AO95070 293 aa16.04■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 TMEM155Q4W5P6 130 aa16.04■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 MALSU1Q96EH3 234 aa16.04■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 PLEKHA3Q9HB20 300 aa16.04■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 SDF2L1Q9HCN8 221 aa16.04■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 REG1BP48304 166 aa16.04■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 FAM71F2Q6NXP2 309 aa16.04■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 OR10X1Q8NGY0 326 aa16.04■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 HARBI1Q96MB7 349 aa16.04■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 PXMP4Q9Y6I8 212 aa16.04■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 CXorf65A6NEN9 183 aa16.03■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 OPN1MWP04001 364 aa16.03■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 OPN1MW2P0DN77 364 aa16.03■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 OPN1MW3P0DN78 364 aa16.03■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 IQCF2Q8IXL9 164 aa16.03■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 MUC15Q8N387 334 aa16.03■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 FKBP11Q9NYL4 201 aa16.03■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 A0A087X0M5 115 aa16.03■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa16.03■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 A0A1B0GX30 115 aa16.03■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 TMEM250H0YL14 139 aa16.03■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 TMEM249Q2WGJ8 235 aa16.03■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 TMEM177Q53S58 311 aa16.03■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 MIC13Q5XKP0 118 aa16.03■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 TMEM186Q96B77 213 aa16.03■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 ADORA2A-AS1P86434 159 aa16.02■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa16.02■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 ELOBQ15370 118 aa16.02■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 CDSNQ15517 529 aa16.02■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 OR5B3Q8NH48 314 aa16.02■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa16.02■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 NABP2Q9BQ15 211 aa16.02■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RTKN-201ENST00000233330 A0A1W2PPV4 95 aa16.02■□□□□ 0.15
RTKN-201ENST00000233330 ZNF343Q6P1L6 599 aa16.02■□□□□ 0.15
RTKN-201ENST00000233330 TEPPQ6URK8 271 aa16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms