RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 SCGB1D1O95968 90 aa14.95□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 IGHG3P01860 377 aa14.95□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 LOXL3P58215 753 aa14.95□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 PRR31Q5SQ13 230 aa14.95□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 LINC01551Q86U37 167 aa14.95□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 TMEM256Q8N2U0 113 aa14.95□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 RND1Q92730 232 aa14.95□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 ZNF320A2RRD8 509 aa14.95□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 GRIFINA4D1Z8 144 aa14.95□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 NUBP1P53384 320 aa14.95□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 WDR83OSQ9Y284 106 aa14.95□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa14.95□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 TIMM9Q9Y5J7 89 aa14.95□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.95□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 MUC6Q6W4X9 2439 aa14.95□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 IL3RAP26951 378 aa14.94□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 CT45A1Q5HYN5 189 aa14.94□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 LYG1Q8N1E2 194 aa14.94□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.94□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 CT45A3Q8NHU0 189 aa14.94□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 GFRA3O60609 400 aa14.94□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 HRASP01112 189 aa14.94□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 HLA-DRB5Q30154 266 aa14.94□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 FAM216BQ8N7L0 139 aa14.94□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 ZBTB34Q8NCN2 500 aa14.94□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 NEU1Q99519 415 aa14.94□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 TGOLN2O43493 480 aa14.93□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 RELBQ01201 579 aa14.93□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 PAX5Q02548 391 aa14.93□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.93□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 CCL13Q99616 98 aa14.93□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.93□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.93□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 DNLZQ5SXM8 178 aa14.93□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 GGTLC1Q9BX51 225 aa14.93□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 CTDSP1Q9GZU7 261 aa14.93□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 PROCRQ9UNN8 238 aa14.93□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa14.92□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 TMEM250H0YL14 139 aa14.92□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 IGKV1-16P04430 117 aa14.92□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 KITLGP21583 273 aa14.92□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 OR5I1Q13606 314 aa14.92□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 FAM90A1Q86YD7 464 aa14.92□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 S1PR3Q99500 378 aa14.92□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 SNHG12Q9BXW3 62 aa14.92□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa14.92□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 TCF19Q9Y242 345 aa14.92□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 SLC35B1P78383 322 aa14.92□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 FAM27E3Q08E93 113 aa14.92□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 ATP6V1FQ16864 119 aa14.92□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 TEX38Q6PEX7 206 aa14.92□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 FAM216AQ8WUB2 273 aa14.92□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 CALYQ9NYX4 217 aa14.92□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 PRR33A8MZF0 331 aa14.91□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 SRRM5B3KS81 715 aa14.91□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 IGFBP2P18065 325 aa14.91□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 REG1BP48304 166 aa14.91□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.91□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 COL12A1Q99715 3063 aa14.91□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 PAX1P15863 534 aa14.91□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 VWC2Q2TAL6 325 aa14.91□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 OCC1Q8TAD7 63 aa14.91□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 PRR7Q8TB68 274 aa14.91□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.91□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 MANBALQ9NQG1 85 aa14.9□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 C17orf112F2Z3M2 114 aa14.9□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 J3QW42 95 aa14.9□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 HPRT1P00492 218 aa14.9□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 CA2P00918 260 aa14.9□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 IGLV1-44P01699 117 aa14.9□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 C17orf58Q2M2W7 97 aa14.9□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 TMEM18Q96B42 140 aa14.9□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 SARAFQ96BY9 339 aa14.9□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 PYGO2Q9BRQ0 406 aa14.9□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 ABCA4P78363 2273 aa14.9□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 MBP02144 154 aa14.9□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 DLX1P56177 255 aa14.9□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PANX1-201ENST00000227638 OR4A47Q6IF82 309 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.6 ms