RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppt1O88531 306 aa22.39■■□□□ 1.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppp1ccP63087 323 aa22.39■■□□□ 1.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prrc1Q3UPH1 443 aa22.39■■□□□ 1.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Wdyhv1Q80WB5 209 aa22.39■■□□□ 1.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rbpms2Q8VC52 206 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Igkv13-84A0A140T8N3 115 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Igkv14-111A0A140T8P9 117 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm12790B1AUV6 201 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 P01660 111 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 GzmaP11032 260 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm5127Q3UQH6 212 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr1341Q7TQV4 312 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dirc2Q8BFQ6 478 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr1420Q8VF55 309 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Egln1Q91YE3 400 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mansc1Q9CR33 414 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cyb561d1A2AE42 229 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr231E9Q0M4 307 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr178E9Q9T3 319 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ifna2P01573 190 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 B230104I21RikQ3USW4 141 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Paqr8Q80ZE5 354 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr493Q8VEW5 314 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr1259Q8VEZ1 309 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pip5k1aP70182 546 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vmn1r179Q8R2B4 323 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cela3bQ9CQ52 269 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q9DAN9 164 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Suclg1Q9WUM5 346 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cldn15Q9Z0S5 227 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rhox7aA2A4F1 281 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr204E9Q8M0 305 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CamlgP49070 294 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr1137Q7TR40 310 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sft2d2Q8VD57 159 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr1368Q8VFG3 314 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr789A0A1L1SV77 312 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cpne2P59108 548 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 SpegQ62407 3262 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr555E9Q547 315 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mcpt8P43430 247 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Htr2bQ02152 479 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gemin8Q8BHE1 238 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Degs2Q8R2F2 323 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Srp19Q9D7A6 144 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vps13cQ8BX70 3748 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tcrg-C4A0A075B6C7 190 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10778A0A087WNP5 499 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 TaglnP37804 201 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm21943Q5FWD5 227 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 9130008F23RikQ9D2Z6 181 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fbp1Q9QXD6 338 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm45783A0A1B0GT48 74 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm6460F6YJZ8 199 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Heatr1G3X9B1 2143 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr224M9MMJ7 314 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 B4galt1P15535 399 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mas1P30554 324 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cks2P56390 79 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rnd3P61588 244 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ElobP62869 118 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sdr39u1Q5M8N4 308 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam57aQ5ND56 257 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc46a1Q6PEM8 459 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cyb5bQ9CQX2 146 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ndufa6Q9CQZ5 131 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc54Q9DAL3 329 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Smco4Q9JIS3 59 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Psmb3Q9R1P1 205 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Map1bP14873 2464 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Muc5acE9QAQ8 3455 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Apobec4Q497M3 374 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gpbar1Q80SS6 329 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q9DAE7 121 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr773F6VS78 311 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 P06335 190 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ear1P97426 155 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rtp3Q5QGU6 474 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Msl2Q69ZF8 577 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cd200r4Q6XJV4 270 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr772Q8VGC5 311 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cisd2Q9CQB5 135 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Phf19Q9CXG9 578 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdk20Q9JHU3 346 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr417F8VQB1 309 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 9130019O22RikG3X941 543 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm6526G3X9Q9 198 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdhr4H3BJZ2 783 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm21788J3QNH3 180 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vamp2P63044 116 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mindy2Q6PDI6 601 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Srsf7Q8BL97 267 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Scgb2b26Q8JZX1 112 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 4933400A11RikQ9CR52 288 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm4787B2RUD9 748 aa22.33■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tcl1b2P56841 117 aa22.33■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Glo1Q9CPU0 184 aa22.33■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mrpl18Q9CQL5 180 aa22.33■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Msmo1Q9CRA4 293 aa22.33■■□□□ 1.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr632Q9EPN9 317 aa22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.8 ms