RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

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Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-205ENST00000641549 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa11.36□□□□□ -0.59
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PTPRVP-205ENST00000641549 J3KRW8 73 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRVP-205ENST00000641549 SMIM6P0DI80 62 aa11.36□□□□□ -0.59
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PTPRVP-205ENST00000641549 SLC25A28Q96A46 364 aa11.35□□□□□ -0.59
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PTPRVP-205ENST00000641549 MARVELD3Q96A59 401 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRVP-205ENST00000641549 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PTPRVP-205ENST00000641549 TRAV20A0A0B4J274 112 aa11.33□□□□□ -0.6
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PTPRVP-205ENST00000641549 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa11.33□□□□□ -0.6
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PTPRVP-205ENST00000641549 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
PTPRVP-205ENST00000641549 Q5BKY6 102 aa11.33□□□□□ -0.6
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PTPRVP-205ENST00000641549 BMPERQ8N8U9 685 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRVP-205ENST00000641549 BET1LQ9NYM9 111 aa11.33□□□□□ -0.6
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PTPRVP-205ENST00000641549 TWIST1Q15672 202 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRVP-205ENST00000641549 LY6EQ16553 131 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRVP-205ENST00000641549 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRVP-205ENST00000641549 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRVP-205ENST00000641549 C19orf67A6NJJ6 358 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRVP-205ENST00000641549 REG1AP05451 166 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRVP-205ENST00000641549 THADAQ6YHU6 1953 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRVP-205ENST00000641549 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.69e-7■■■■□ 21.4
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM201AQ5SY85 155 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRVP-205ENST00000641549 NABP1Q96AH0 204 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRVP-205ENST00000641549 MGAMO43451 1857 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRVP-205ENST00000641549 A0A0G2JLM5 398 aa11.31□□□□□ -0.6
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