RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 AKIP1Q9NQ31 210 aa22.24■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa22.23■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM223BA6NKX1 122 aa22.23■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 TRBV12-3P01733 135 aa22.23■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 PMP2P02689 132 aa22.23■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 GP9P14770 177 aa22.23■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 RFX2P48378 723 aa22.23■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 SYNJ2BPP57105 145 aa22.23■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 RPEL1Q2QD12 228 aa22.23■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM223AQ8IWN6 122 aa22.23■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 TTC9CQ8N5M4 171 aa22.23■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 OR5H2Q8NGV7 314 aa22.23■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 OR51H1Q8NH63 302 aa22.23■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 HRASLSQ9HDD0 168 aa22.23■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 TRIM64CA6NLI5 447 aa22.22■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 MAS1LP35410 378 aa22.22■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 TAS2R46P59540 309 aa22.22■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 AADACL3Q5VUY0 350 aa22.22■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa22.22■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 BORCS5Q969J3 196 aa22.22■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 COL7A1Q02388 2944 aa22.22■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 TNCP24821 2201 aa22.21■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 RPL8P62917 257 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF45Q02386 682 aa22.21■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 OR9G4Q8NGQ1 327 aa22.21■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 OR2J3O76001 311 aa22.2■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 OR4A47Q6IF82 309 aa22.2■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 NECAP1Q8NC96 275 aa22.2■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa22.2■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 TEX22C9J3V5 150 aa22.19■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.141e-11■■■□□ 16.9
SEMA3B-215ENST00000621029 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 HLA-GP17693 338 aa22.19■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 ADAM30Q9UKF2 790 aa22.19■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 SORL1Q92673 2214 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 HPRT1P00492 218 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 APOA1P02647 267 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 HLA-DMAP28067 261 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 DHRS11Q6UWP2 260 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 C19orf35Q6ZS72 473 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 SNX29P2Q8IUI4 249 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 OR4A5Q8NH83 315 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 CD300LFQ8TDQ1 290 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC2A9Q9NRM0 540 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 BET1LQ9NYM9 111 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 ANAPC10Q9UM13 185 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 E7EUB6 86 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 MYOD1P15172 320 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 NQO2P16083 231 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 GNRHRP30968 328 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 RORCP51449 518 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 TAS2R31P59538 309 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 C15orf32Q32M92 178 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 DMBX1Q8NFW5 382 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 OR6F1Q8NGZ6 308 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 FBXL7Q9UJT9 491 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 U3KQK5 164 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 HPGDSO60760 199 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 DHFRP00374 187 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 IGLV1-51P01701 117 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF735P0CB33 412 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 AREGP15514 252 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 RPA2P15927 270 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 NAT1P18440 290 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 MOB3AQ96BX8 217 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 NPIPB5A8MRT5 1133 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 S1PR2O95136 353 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 RLN1P04808 185 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 DEFA4P12838 97 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 HRH1P35367 487 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 CMTM1Q8IZ96 169 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 CMTM3Q96MX0 182 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 DNAH9Q9NYC9 4486 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM25AB3EWG3 89 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM25CB3EWG5 89 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM25GB3EWG6 89 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-215ENST00000621029 REG1AP05451 166 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-215ENST00000621029 ELK1P19419 428 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-215ENST00000621029 PSMB6P28072 239 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-215ENST00000621029 TSPAN5P62079 268 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-215ENST00000621029 MZT2AQ6P582 158 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-215ENST00000621029 LYSMD2Q8IV50 215 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-215ENST00000621029 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-215ENST00000621029 COMMD5Q9GZQ3 224 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-215ENST00000621029 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-215ENST00000621029 PLEKHA2Q9HB19 425 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-215ENST00000621029 PEMTQ9UBM1 199 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-215ENST00000621029 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-215ENST00000621029 A0A1B0GW64 132 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-215ENST00000621029 BMPR1BO00238 502 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-215ENST00000621029 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-215ENST00000621029 ERVK-16P61578 105 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-215ENST00000621029 GPX8Q8TED1 209 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms